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Enregistrement W2768009295 · doi:10.1111/nph.14779

Introgression from<i>Populus balsamifera</i>underlies adaptively significant variation and range boundaries in<i>P. trichocarpa</i>

2017· article· en· W2768009295 sur OpenAlexafffund
Adriana Suarez‐Gonzalez, Charles A. Hefer, Christian Lexer, Carl J. Douglas, Quentin Cronk

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Forests, Lands and Natural Resource OperationsSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungGenome Canada
Mots-clésIntrogressionPopulus trichocarpaBiologyGenetic architectureGenetic admixtureAdaptation (eye)Evolutionary biologyGeneticsBotanyQuantitative trait locusGenePopulationGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introgression can be an important source of adaptive phenotypes, although conversely it can have deleterious effects. Evidence for adaptive introgression is accumulating but information on the genetic architecture of introgressed traits lags behind. Here we determine trait architecture in Populus trichocarpa under introgression from P. balsamifera using admixture mapping and phenotypic analyses. Our results reveal that admixture is a key driver of clinal adaptation and suggest that the northern range extension of P. trichocarpa depends, at least in part, on introgression from P. balsamifera. However, admixture with P. balsamifera can lead to potentially maladaptive early phenology, and a reduction in growth and disease resistance in P. trichocarpa. Strikingly, an introgressed chromosome 9 haplotype block from P. balsamifera restores the late phenology and high growth parental phenotype in admixed P. trichocarpa. This epistatic restorer block may be strongly advantageous in maximizing carbon assimilation and disease resistance in the southernmost populations where admixture has been detected. We also confirm a previously demonstrated case of adaptive introgression in chromosome 15 and show that introgression generates a transgressive chlorophyll-content phenotype. We provide strong support that introgression provides a reservoir of genetic variation associated with adaptive characters that allows improved survival in new environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,209
Score d'incertitude au seuil0,549

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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