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Enregistrement W2768082034 · doi:10.1111/cmi.12799

PtaB, a lim-domain binding protein in<i>Aspergillus fumigatus</i>regulates biofilm formation and conidiation through distinct pathways

2017· article· en· W2768082034 sur OpenAlexafffund
Yuan Chen, Zhihua Ma, Qiuyi Chen, Hanna Ostapska, Fabrice N. Gravelat, Ling Lü, Donald C. Sheppard

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of ChinaNational Science Foundation
Mots-clésConidiationBiologyBiofilmMutantCell biologyFungal proteinMicrobiologyGeneBiochemistryGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The exopolysaccharide galactosaminogalactan (GAG) plays an important role in mediating adhesion, biofilm formation, and virulence in the pathogenic fungus Aspergillus fumigatus. The developmental modifiers MedA, StuA, and SomA regulate GAG biosynthesis, but the mechanisms underlying this regulation are poorly understood. PtaB is a lim-domain binding protein that interacts with the transcription factor SomA and is required for normal conidiation and biofilm formation. Disruption of ptaB resulted in impaired GAG production and conidiation in association with a markedly reduced expression of GAG biosynthetic genes (uge3 and agd3), developmental regulators (medA and stuA), and genes involved in the core conidiation pathway. Overexpression of medA and dual overexpression of uge3 and agd3 in the ΔptaB mutant increased biofilm formation but not conidiation, whereas overexpression of core conidiation genes rescued conidiation but not biofilm formation. Overexpression of stuA modestly increased both conidiation and biofilm formation. Analysis of ptaB truncation mutants revealed that overexpression of the lim-domain binding region restored conidiation but not biofilm formation, suggesting that ptaB may govern these processes by interacting with different partners. These studies establish that PtaB governs GAG biosynthesis at the level of substrate availability and polymer deacetylation and that PtaB-mediated biofilm formation and conidiation are largely independent pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,745

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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