Molecular phylogeny of the genus Themisto (Guérin, 1925) (Amphipoda: Hyperiidae) in the Northern Hemisphere
Notice bibliographique
Résumé
The Amphipoda is a highly speciose order of crustaceans with a life cycle characterized by direct development and no larval stage, making them interesting models for studies on marine speciation. The family Hyperiidae Dana, 1852 is a strictly pelagic group of Amphipoda. In northern latitudes, free-swimming hyperiids belonging to the genus Themisto (Guérin, 1825) are important components of marine ecosystems in term of abundance and biomass, but little is known about their genetic relationships. We present the first multi-locus molecular phylogenetic assessment of the Themisto in the Northern Hemisphere. We performed Bayesian and maximum likelihood reconstructions based on three nuclear loci (18S rDNA, 28S rDNA, and Histone 3) and mitochondrial cytochrome oxidase I data on eight specimens of Themisto from the Pacific, Arctic, and Atlantic oceans. We also provide an updated molecular phylogeny of Hyperiidae. Based on our multi-locus phylogeny, we report the presence of cryptic species in the North Pacific. Our results are discussed in the light of marine speciation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».