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Enregistrement W2768838800 · doi:10.1002/ajmg.b.32601

Contribution of genes in the GABAergic pathway to bipolar disorder and its executive function deficit in the Chinese Han population

2017· article· en· W2768838800 sur OpenAlexaff
Hongyan Ren, Lijie Guan, Liansheng Zhao, Yin C. Lin, Yincheng Wang, Zhenxing Yang, Xuan Li, Xiaohong Ma, Xiongchao Cheng, Wenhao Deng, Katherine J. Aitchison, Liping Cao, Tao Li

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaScience and Technology Planning Project of Guangdong ProvinceGuangzhou Brain HospitalNational Natural Science Foundation of ChinaWellcome Trust
Mots-clésBipolar disorderGABAergicHan chinesePopulationChinese populationNeurosciencePsychologyPsychiatryGeneGeneticsMedicineBiologyCognitionSingle-nucleotide polymorphismGenotypeEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, we investigated the association between bipolar I disorder (BDI) and between cognitive deficits therein and SNPs in GABAergic receptor genes. The sample comprised 477 patients with BDI and 438 healthy controls, with three neurocognitive tests being administered in 123 patients and 164 controls. For three SNPs, rs505474, rs1398175, and rs4868029 in the GABRA2, GABRA4, and GABRP genes, respectively, their allele frequencies were significantly different between patients and controls (Bonferroni‐adjusted p = values 3.84 × 10−4, 9.92 × 10−3, and 1.22 × 10−2, respectively). Four haplotypes were significantly associated with BDI (TA and AG for rs3815762 and rs4868029 in GABRP, GG for rs11636988 and rs8024256 in GABRB3 and GAGG for rs2197414, rs4921195, rs13188991, and rs11956731 in GABRA6, with p values of 0.0038, 0.044, 0.0176, and 0.0267, respectively, on 10,000 permutations). Furthermore, the SNP (rs2912585) within 250 kb upstream of the GABRB3 gene displayed a strong association with the Tower of Hanoi (TOH) executive time in the patient group (p = 2.844 × 10−6). One other SNP (rs754661), which is located at the intronic region of the same gene, was associated with the global trait of the executive function and post hoc analysis showed significant SNP by group effect (p = 0.0094). Our study supports previous findings that GABAA receptor genes are associated with bipolar disorder; it also suggests that the GABAA genes, especially the GABRB3 gene, might play a role in the executive function deficit in bipolar disorder, although future replication with a larger sample size is needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,050

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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