Enregistrement W2768977396 · doi:10.1016/j.cell.2017.10.032

Core Clinical Data Elements for Cancer Genomic Repositories: A Multi-stakeholder Consensus

2017· article· en· W2768977396 sur OpenAlexfundno aff

Robert B. Conley, Dane J. Dickson, Jean C. Zenklusen, Jennifer Al Naber, Donna A. Messner, Ajlan Atasoy, Lena Chaihorsky, Deborah Collyar, Carolyn C. Compton, Martin L. Ferguson, Sean Khozin, Roger D. Klein, Sri Kotte, Razelle Kurzrock, Christopher Lin, Frank Liu, Ingrid Marino, Robert McDonough, A. Scott McNeal, Vincent Miller, Richard L. Schilsky, Lisa I. Wang

Notice bibliographique

RevueCell · 2017

Typearticle

Langueen

DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology

ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics

Établissements canadiensnon disponible

Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteFoundation MedicineGenentechActuate TherapeuticsXBiotechGenomic HealthNateraExelixisMerckAmgenCancer Research SocietyAmerican Association for Cancer Research

Mots-clésBiologyStakeholderCore (optical fiber)Computational biologySet (abstract data type)Consensus conferenceData scienceBioinformaticsLibrary scienceComputer sciencePublic relationsPolitical science

DOI10.1016/j.cell.2017.10.032

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,385

score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,291

Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated

Catégories candidatesMétarecherche

Catégories consensuellesMétarecherche

DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune

Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune

GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune

Score de désaccord entre enseignants0,615

Score d'incertitude au seuil0,758

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,385	0,291
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,002	0,003
Méta-épidémiologie (sens large)	0,004	0,004
Bibliométrie	0,009	0,008
Études des sciences et des technologies	0,007	0,011
Communication savante	0,029	0,039
Science ouverte	0,018	0,031
Intégrité de la recherche	0,020	0,028
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,008	0,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,265

Tête enseignante GPT0,414

Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail

Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle