Quantitative, Wide-Spectrum Kinase Profiling in Live Cells for Assessing the Effect of Cellular ATP on Target Engagement

2017· article· en· 293 citations· W2769161116 sur OpenAlex· 10.1016/j.chembiol.2017.10.010

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates: aucune
Catégories consensuelles: aucune
Domaine: Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude: Signal candidat: Expérimental (laboratoire)Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
Genre: Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants: 0,005
Score d'incertitude au seuil: 0,653
Statut de validation: machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,001	0,001
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,000	0,000
Méta-épidémiologie (sens large)	0,000	0,000
Bibliométrie	0,000	0,000
Études des sciences et des technologies	0,000	0,000
Communication savante	0,000	0,000
Science ouverte	0,001	0,000
Intégrité de la recherche	0,000	0,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,000	0,000

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,022

Tête enseignante GPT0,318

Écart entre enseignants: 0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

For kinase inhibitors, intracellular target selectivity is fundamental to pharmacological mechanism. Although a number of acellular techniques have been developed to measure kinase binding or enzymatic inhibition, such approaches can fail to accurately predict engagement in cells. Here we report the application of an energy transfer technique that enabled the first broad-spectrum, equilibrium-based approach to quantitatively profile target occupancy and compound affinity in live cells. Using this method, we performed a selectivity profiling for clinically relevant kinase inhibitors against 178 full-length kinases, and a mechanistic interrogation of the potency offsets observed between cellular and biochemical analysis. For the multikinase inhibitor crizotinib, our approach accurately predicted cellular potency and revealed improved target selectivity compared with biochemical measurements. Due to cellular ATP, a number of putative crizotinib targets are unexpectedly disengaged in live cells at a clinically relevant drug dose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue: Cell chemical biology
Thématique: PI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: non disponible
Organismes subventionnaires: National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesJanssen BiotechInnovative Medicines InitiativeOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceOntario Genomics InstituteCanada Foundation for InnovationNovartis PharmaWellcome TrustAbbVieMerck KGaAGenome CanadaPfizer
Mots-clés: CrizotinibKinasePotencyProfiling (computer programming)IntracellularDrug discoveryChemistryComputational biologySelectivityCell biologyBiologyBiochemistryIn vitroComputer scienceMedicine
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W2769161116