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Enregistrement W2769361755 · doi:10.4049/jimmunol.196.supp.126.27

Identification of two MCMV immunoevasins that modulate NK cell recognition via the NKR-P1B:Clr-b axis

2016· article· en· W2769361755 sur OpenAlexaff
Oscar A. Aguilar, Mir Munir A. Rahim, Johanna Reichel, Timothy Lau, Jackeline Samaniego, Isabella dos Santos Sampaio, Astrid Krmpotić, Stipan Jonjić, Andrew P. Makrigiannis, David Allan, James R. Carlyle

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of OttawaCentre for Social InnovationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyComplementationMutantEctopic expressionReceptorCellCell biologyPhenotypeLigand (biochemistry)TransfectionHEK 293 cellsCell cultureGeneMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Natural killer (NK) cells are a subset of innate lymphoid cells (ILC) capable of recognizing pathological target cells through germline-encoded receptor-ligand interactions. Murine cytomegalovirus (MCMV) is a betaherpesvirus that has co-evolved with its natural host, and as such, a significant portion of its genome encodes immunoevasins that directly target NK cell receptor-ligand interactions. Here, we identify two putative immunoevasins that modulate host-pathogen interactions via the inhibitory NKR-P1B:Clr-b recognition system. First, we identify an m145 family member, m153, that actively prevents MCMV infection-mediated Clr-b downregulation. Ectopic expression of m153 in mouse fibroblasts increases Clr-b expression at the cell surface. In contrast, infection with a virus deficient in m153 shows more substantial Clr-b loss at the cell surface compared to wild-type MCMV. Importantly, enhanced Clr-b loss upon infection with the m153-mutant could be reversed upon m153 complementation by overexpression. Secondly, we have identified an m02 family member, m12, that directly interacts with the NKR-P1B inhibitory receptor in reporter cell assays. Notably, the interaction between NKR-P1B and m12 is both Clr-b/β2m-independent, and infection of fibroblasts with m12-mutant MCMV abrogates NKR-P1B ligation on reporter cells. This interaction, suggestive of decoy ligand function, is also both MCMV strain-dependent and host NKR-P1B allele-specific, suggesting that polymorphisms have evolved at both the pathogen and host levels that affect NK cell recognition of infected target cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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