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Enregistrement W2769976663 · doi:10.1139/facets-2016-0061

Diversity of parasitoid and parasitic wasps across a latitudinal gradient: Using public DNA records to work within a taxonomic impediment

2017· article· en· W2769976663 sur OpenAlexafffundvenue
Thanushi Eagalle, M. Alex Smith

Notice bibliographique

RevueFACETS · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChurchill Northern Studies CentreCentre National de la Recherche ScientifiqueOntario Genomics InstituteCanadian Nuclear Safety CommissionGovernment of CanadaParks CanadaOntario GenomicsGenome CanadaMinistry of Natural Resources
Mots-clésParasitoidBiologyEcologyLatitudeSpecies diversityAbiotic componentDNA barcodingPhylogenetic diversityBiodiversityPhylogenetic treeEvolutionary biologyHymenopteraGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diversity of insect parasitoids (Hymenoptera) has long been thought to be anomalous because it doesn’t appear to increase rapidly with decreasing latitude. However, due to the presence of undiscovered cryptic species and the under-sampling of hyper-diverse tropical areas, such apparently anomalous gradients may, in fact, be artifacts of limited geographic and taxonomic sampling. We attempted to circumvent such taxonomic impediments by elucidating a diversity/latitude relationship for parasitoid wasps, using publicly available DNA sequences to quantify diversity (via a species proxy molecular operational taxonomic unit (the DNA Barcode Index Number) and phylogenetic diversity) across a latitudinal gradient of ∼5000 km. We compared these diversity values to the abiotic factors (temperature and precipitation) that may drive the diversity/latitude relationship. We found no significant relationship between either diversity measure with latitude or with the environmental variables. Although ours is the first work to enumerate different DNA-based measures of parasitoid diversity across this geographic scale in a standardized fashion using publicly available sequences, further standardized collections over long time periods and a rapid movement of sequences into the public arena are needed to facilitate the further testing of macroecological trends elucidated with public DNA sequence libraries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,147
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,132 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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