A switch of chlorinated substrate causes emergence of a previously undetected native Dehalobacter population in an established Dehalococcoides-dominated chloroethene-dechlorinating enrichment culture
Notice bibliographique
Résumé
Chlorobenzenes are soil and groundwater pollutants of concern that can be reductively dehalogenated by organohalide-respiring bacteria from the genera Dehalococcoides and Dehalobacter. The bioaugmentation culture KB-1® harbours Dehalococcoides mccartyi spp. that reductively dehalogenate trichloroethene to ethene. It contains more than 30 reductive dehalogenase genes; some of them are highly similar to genes found in the chlorobenzene-respiring Dehalococcoides mccartyi strain CBDB1. We explored the chlorobenzene dehalogenation capability of the KB-1 enrichment culture using 1,2,4-trichlorobenzene (1,2,4-TCB). We achieved adaptation of KB-1 to 1,2,4-TCB that is dehalogenated to a mixture of dichlorobenzenes, and subsequently to monochlorobenzene and benzene. Surprisingly, a native Dehalobacter population, and not a Dehalococcoides population, couples the dechlorination of 1,2,4-TCB to growth achieving an average yield of 1.1 ± 0.6 × 1013 cells per mole of Cl- released. Interestingly, the dechlorination of 1,2,4-TCB occurs alongside the complete dechlorination of trichloroethene to ethene in cultures fed both electron acceptors. Dehalobacter was not previously identified as a major player in KB-1, but its ecological niche was favoured by the introduction of 1,2,4-TCB. Based on 16S rRNA phylogeny, Dehalobacter populations seem to cluster into specialised clades, and are likely undergoing substrate specialisation as a strategy to reduce competition for electron acceptors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».