An outbreak of classical swine fever in pigs in Bangladesh, 2015
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In a group of 22 healthy pigs aged between 4 and 6 months, 2 pigs became ill with high fever, complete anorexia, cough and abnormal swaying movements on 22 June 2015. One of them died on June 24 and the second died on July 3. Shortly after, the remaining pigs also fell ill and died from the same illness by 10 August 2015. We investigated the aetiology, epidemiological and clinical features of the outbreak. We recorded the clinical signs and symptoms for each pig with the date of onset of illness. Veterinarians conducted post‐mortem examinations on the 12 dead pigs, they collected tissue samples from the dead pigs and placed them in a tube containing 1 mL of nucleic acid extraction buffer (lysis buffer). We tested all the tissue samples by real‐time reverse transcription polymerase chain reaction ( rRT ‐ PCR ) to detect classical swine fever virus ( CSFV ) because the animals’ symptoms matched those of this disease. We also conducted a phylogentic analysis of the nucleotide sequence of the E2 gene segment of CSFV detected in a lung tissue sample. The attack rate (22/22) and the case fatality were 100%. The predominant symptoms of the disease included high fever, cough, diarrhoea and swaying movements of the hind legs prior to death. Of the 12 pigs tissue samples tested, all had evidence of the presence of CSFV RNA by rRT ‐ PCR . The phylogenetic analysis indicated that the virus belongs to genotype 2.2, which is closely related to CSFV genotype 2.2 reported in India. Our investigation suggests that CSF is circulating in pigs, posing a risk for communities in Bangladesh that rely on pigs for economic income and dietary protein. Future research could focus on estimating the disease and economic burden of CSFV in pig rearing areas to determine if interventions might be warranted or cost‐effective.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».