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Enregistrement W2770576318 · doi:10.1139/cjm-2017-0561

Plasmid AZOBR_p1-borne <i>fabG</i> gene for putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase is essential for proper assembly and work of the dual flagellar system in the alphaproteobacterium <i>Azospirillum brasilense</i> Sp245

2017· article· en· W2770576318 sur OpenAlexvenueno aff
Yu. A. Filip’echeva, А. В. Шелудько, А. Г. Прилипов, Gennady L. Burygin, Е. М. Телешева, Stella S. Yevstigneyeva, Marina P. Chernyshova, Л. П. Петрова, Е. И. Кацы

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPlasmidGeneFlagellumDual (grammatical number)ReductaseWork (physics)GeneticsEnzymeComputational biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Azospirillum brasilense can swim and swarm owing to the activity of a constitutive polar flagellum (Fla) and inducible lateral flagella (Laf), respectively. Experimental data on the regulation of the Fla and Laf assembly in azospirilla are scarce. Here, the coding sequence (CDS) AZOBR_p1160043 (fabG1) for a putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein (ACP)] reductase was found essential for the construction of both types of flagella. In an immotile leaky Fla− Laf− fabG1::Omegon-Km mutant, Sp245.1610, defects in flagellation and motility were fully complemented by expressing the CDS AZOBR_p1160043 from plasmid pRK415. When pRK415 with the cloned CDS AZOBR_p1160045 (fliC) for a putative 65.2 kDa Sp245 Fla flagellin was transferred into the Sp245.1610 cells, the bacteria also became able to assemble a motile single flagellum. Some cells, however, had unusual swimming behavior, probably because of the side location of the organelle. Although the assembly of Laf was not restored in Sp245.1610 (pRK415-p1160045), this strain was somewhat capable of swarming motility. We propose that the putative 3-oxoacyl-[ACP] reductase encoded by the CDS AZOBR_p1160043 plays a role in correct flagellar location in the cell envelope and (or) in flagellar modification(s), which are also required for the inducible construction of Laf and for proper swimming and swarming motility of A. brasilense Sp245.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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