Quantitative proteomic profiling of bovine follicular fluid during follicle development†
Notice bibliographique
Résumé
Bovine follicular fluid (FF) constitutes the microenvironment of follicles and includes various biologically active proteins. We performed a study involving 18 healthy nonlactating Holstein cows to determine the protein expression profile of FF at key stages of follicular development. Follicles were individually aspirated in vivo at predeviation (F1 ∼ 7.0 mm), deviation (F1 ∼ 8.5 mm), postdeviation (F1 ∼ 12.0 mm), and preovulatory stages of follicle development, which were confirmed by measurement of follicular estradiol and progesterone concentrations. The FFs from nine cows were selected for proteomic analysis. After albumin depletion, triplicates of pooled FF were reduced, alkylated, and digested with trypsin. The resulting peptides were labeled with TMTsixplex and quantified using liquid chromatography-mass spectrometry/mass spectrometry. A total of 143 proteins were identified and assigned to a variety of biological processes, including response to stimulus and metabolic processes. Twenty-two differentially (P < 0.05) expressed proteins were found between stages indicating intrafollicular changes over development, with expected deviation time critical to modulate the protein expression. For instance, high concentrations of follistatin, inhibin, serglycin, spondin-1, fibrinogen, and anti-testosterone antibody were found during early stages of follicular development. In contrast, apolipoprotein H, alpha-2-macroglobulin, plasminogen, antithrombin-III, and immunoglobulins were increased after deviation. Among the differentially abundant proteins, 19 were found to be associated with steroidogenesis. Pathway analysis identified proteins that were mainly associated with the acute phase response signaling, coagulation system, complement system, liver/retinoid X receptor activation, and biosynthesis of nitric oxide and reactive oxygen. The differentially expressed proteins provide insights into the size-dependent protein changes in the ovarian follicle microenvironment that could influence follicular function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».