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Enregistrement W2770705758 · doi:10.1194/jlr.m079996

Flipping the cyclooxygenase (Ptgs) genes reveals isoform-specific compensatory functions ,

2017· article· en· W2770705758 sur OpenAlexaff
Xinzhi Li, Liudmila L. Mazaleuskaya, Chong Yuan, Laurel L. Ballantyne, Hu Meng, William L. Smith, Garret A. FitzGerald, Colin Funk

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésGene isoformCyclooxygenaseProstaglandinCell biologyGeneChemistryBiologyMolecular biologyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two prostaglandin (PG) H synthases encoded by Ptgs genes, colloquially known as cyclooxygenase (COX)-1 and COX-2, catalyze the formation of PG endoperoxide H 2 , the precursor of the major prostanoids. To address the functional interchangeability of these two isoforms and their distinct roles, we have generated COX-2>COX-1 mice whereby Ptgs2 is knocked in to the Ptgs1 locus. We then "flipped" Ptgs genes to successfully create the Reversa mouse strain, where knock-in COX-2 is expressed constitutively and knock-in COX-1 is lipopolysaccharide (LPS) inducible. In macrophages, flipping the two Ptgs genes has no obvious impact on COX protein subcellular localization. COX-1 was shown to compensate for PG synthesis at high concentrations of substrate, whereas elevated LPS-induced PG production was only observed for cells expressing endogenous COX-2. Differential tissue-specific patterns of expression of the knock-in proteins were evident. Thus, platelets from COX-2>COX-1 and Reversa mice failed to express knock-in COX-2 and, therefore, thromboxane (Tx) production in vitro and urinary Tx metabolite formation in COX-2>COX-1 and Reversa mice in vivo were substantially decreased relative to WT and COX-1>COX-2 mice. Manipulation of COXs revealed isoform-specific compensatory functions and variable degrees of interchangeability for PG biosynthesis in cells/tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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