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Enregistrement W2770750538 · doi:10.1186/s12864-017-4192-6

Genes to predict VO2max trainability: a systematic review

2017· review· en· W2770750538 sur OpenAlexaff
Camilla J. Williams, Mark Williams, Nir Eynon, Kevin J. Ashton, Jonathan P. Little, Ulrik Wisløff, Jeff S. Coombes

Notice bibliographique

RevueBMC Genomics · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Physical Performance
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCardiorespiratory fitnessGenome-wide association studyDiseaseBiologyGenetic associationAerobic exerciseCandidate geneVO2 maxGeneticsMedicineBioinformaticsGeneGenotypePhysical therapyInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismPhysiologyBlood pressure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiorespiratory fitness (VO 2max ) is an excellent predictor of chronic disease morbidity and mortality risk. Guidelines recommend individuals undertake exercise training to improve VO 2max for chronic disease reduction. However, there are large inter-individual differences between exercise training responses. This systematic review is aimed at identifying genetic variants that are associated with VO 2max trainability. Peer-reviewed research papers published up until October 2016 from four databases were examined. Articles were included if they examined genetic variants, incorporated a supervised aerobic exercise intervention; and measured VO 2max /VO 2peak pre and post-intervention. Thirty-five articles describing 15 cohorts met the criteria for inclusion. The majority of studies used a cross-sectional retrospective design. Thirty-two studies researched candidate genes, two used Genome-Wide Association Studies (GWAS), and one examined mRNA gene expression data, in addition to a GWAS. Across these studies, 97 genes to predict VO 2max trainability were identified. Studies found phenotype to be dependent on several of these genotypes/variants, with higher responders to exercise training having more positive response alleles than lower responders (greater gene predictor score). Only 13 genetic variants were reproduced by more than two authors. Several other limitations were noted throughout these studies, including the robustness of significance for identified variants, small sample sizes, limited cohorts focused primarily on Caucasian populations, and minimal baseline data. These factors, along with differences in exercise training programs, diet and other environmental gene expression mediators, likely influence the ideal traits for VO 2max trainability. Ninety-seven genes have been identified as possible predictors of VO 2max trainability. To verify the strength of these findings and to identify if there are more genetic variants and/or mediators, further tightly-controlled studies that measure a range of biomarkers across ethnicities are required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,004
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations148
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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