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Enregistrement W2770841484 · doi:10.1002/ijc.31178

Prognostic utility of six mutated genes for older patients with acute myeloid leukemia

2017· article· en· W2770841484 sur OpenAlexaff
Jinghan Wang, Zhixin Ma, Qinrong Wang, Qi Guo, Jiansong Huang, Wenjuan Yu, Huanping Wang, Jingwen Huang, Yang Shao, Suning Chen, Jie Jin

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensOntario Power Generation
Organismes subventionnairesCollege of Medicine, University of CincinnatiNational Natural Science Foundation of ChinaStrongUniversity of Cincinnati
Mots-clésCEBPANPM1MedicineMyeloid leukemiaOncologyInternal medicineCohortNomogramSanger sequencingMyeloidGeneMutationGeneticsBiologyKaryotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Approximately 50% of older patients with acute myeloid leukemia (AML) do not obtain chromosomal abnormalities as an effective risk-stratification, and present cytogenetically normal AML (CN-AML). To develop a reliable prediction model for stratifying the risk of these elderly patients, we conducted a study with a discovery and validation design. As a result, we found the top 6 mutated genes in the discovery cohort of 26 case by the whole exome sequencing, and verified as recurrent mutations in the large cohort of 329 patients by Sanger sequencing. The top 6 genes were NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A, CEBPA double allele, IDH1 and IDH2 mutations, and the frequency of each gene in the combining cohort was 36.8%, 19.8%, 20.1%, 5.8%, 14.9% and 22.5%, respectively. In addition, clinical variables such as age, white blood cell counts, genes of IDH1 and DNMT3A mutations, European LeukemiaNet genotype (NPM1 mutations and lacking FLT3-ITD or CEBPA double allele mutations) and treatment protocols were independent factors for predicting the probabilities of overall and event-free survival. The prediction nomograms based on these significant factors showed accurate discrimination. In conclusion, we developed a reliable prediction model for stratifying the risk of elderly patients with CN-AML.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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