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Enregistrement W2770845723 · doi:10.1242/dev.156349

FOX and ETS family transcription factors regulate the pigment cell lineage in planarians

2017· article· en· W2770845723 sur OpenAlexafffund
Xinwen He, Nicole Lindsay‐Mosher, Yan Li, Alyssa M. Molinaro, Jason Pellettieri, Bret J. Pearson

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlanarian Biology and Electrostimulation
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenOntario Institute for Cancer ResearchNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésBiologyTranscription factorLineage (genetic)Cell biologyCell lineageEvolutionary biologyGeneticsTranscription (linguistics)GeneCellular differentiation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many pigment cells acquire unique structural properties and gene expression profiles during animal development. The underlying differentiation pathways have been well characterized in cells formed during embryogenesis, such as the neural crest-derived melanocyte. However, much less is known about the developmental origins of pigment cells produced in adult organisms during tissue homeostasis and repair. Here we report a lineage analysis of ommochrome- and porphyrin-producing cells in the brown, freshwater planarian Schmidtea mediterranea. Using an RNA-sequencing approach, we identified two classes of markers expressed in sequential fashion when new pigment cells are generated during regeneration or in response to pigment cell ablation. We also report roles for FOXF-1 and ETS-1 transcription factors, as well as for an FGFR-like molecule, in the specification and maintenance of this cell type. Together, our results provide insights into mechanisms of adult pigment cell development in the strikingly colorful Platyhelminthes phylum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,728
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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