Microarray analysis of gene expression in the cyclooxygenase knockout mice – a connection to autism spectrum disorder
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The cellular and molecular events that take place during brain development play an important role in governing function of the mature brain. Lipid‐signalling molecules such as prostaglandin E2 (PGE2) play an important role in healthy brain development. Abnormalities along the COX‐PGE2 signalling pathway due to genetic or environmental causes have been linked to autism spectrum disorder (ASD). This study aims to evaluate the effect of altered COX‐PGE2 signalling on development and function of the prenatal brain using male mice lacking cyclooxygenase‐1 and cyclooxygenase‐2 (COX‐1−/− and COX‐2−/−) as potential model systems of ASD. Microarray analysis was used to determine global changes in gene expression during embryonic days 16 (E16) and 19 (E19). Gene Ontology: Biological Process (GO:BP) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) were implemented to identify affected developmental genes and cellular processes. We found that in both knockouts the brain at E16 had nearly twice as many differentially expressed genes, and affected biological pathways containing various ASD‐associated genes important in neuronal function. Interestingly, using GeneMANIA and Cytoscape we also show that the ASD‐risk genes identified in both COX‐1−/−and COX‐2−/− models belong to protein‐interaction networks important for brain development despite of different cellular localization of these enzymes. Lastly, we identified eight genes that belong to the Wnt signalling pathways exclusively in the COX‐2−/− mice at E16. The level of PKA‐phosphorylated β‐catenin (S552), a major activator of the Wnt pathway, was increased in this model, suggesting crosstalk between the COX‐2‐PGE2 and Wnt pathways during early brain development. Overall, these results provide further molecular insight into the contribution of the COX‐PGE2 pathways to ASD and demonstrate that COX‐1−/− and COX‐2−/− animals might be suitable new model systems for studying the disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».