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Enregistrement W2770876573 · doi:10.1186/s12881-017-0495-3

Effect of a rare genetic variant of TM7SF4 gene on osteoclasts of patients with Paget’s disease of bone

2017· article· en· W2770876573 sur OpenAlexafffund
Emilie Laurier, Nathalie Amiable, Édith Gagnon, Jacques P. Brown, Laëtitia Michou

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone health and treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésHuman geneticsPaget's disease of boneDiseaseGeneCytogeneticsGeneticsBiologyMedicineBioinformaticsComputational biologyPathologyChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Dendritic Cell-Specific Transmembrane Protein (DC-STAMP) is involved in osteoclastogenesis with a key role in mononucleated osteoclasts fusion. We reported in patients with Paget's disease of bone (PDB) a rare variant (rs62620995) in the TM7SF4 gene, encoding for DC-STAMP, which changes a highly conserved amino acid, possibly damaging according to in silico predictions. This study aimed at determining the functional effects of this variant on osteoclast phenotype in PDB. METHODS: Fifty ml of peripheral blood were collected in pagetic patients carrier of this variant (n = 4) or not (n = 4) and healthy controls (n = 4). Monocytes were collected after Ficoll gradient and cultured in a medium containing RANKL (40 ng/ml) and hMCSF (25 ng/ml). At the end of the differentiation period, we assessed the osteoclast morphology and bone resorption abilities. We quantified gene expression of SQSTM1, DC-STAMP, OS9, CREB3, LAMP1, OC-STAMP, and NFATC1 genes from cell lysates. Proteins encoded by these genes were investigated by Western Blot. Statistical analyses relied on ANOVA followed by Tukey post-tests. RESULTS: After 21 days of differentiation, the mean number of nuclei per multinucleated cell was significantly higher in pagetic patients carrier of the variant than in healthy controls. Bone resorption abilities were not modified by the variant. qPCR and Western Blot analyses did not provide any differences, but DC-STAMP expression was higher in patients carrier of the variant than in patients non carrier. CONCLUSIONS: This TM7SF4 rare variant may have an impact on osteoclast morphology and on DC-STAMP expression during osteoclastogenesis. Further analyses are required to understand the role of this variant during osteoclastogenesis in PDB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,532

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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