MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2771254572 · doi:10.1002/cyto.a.23283

Atomic mass tag of bismuth‐209 for increasing the immunoassay multiplexing capacity of mass cytometry

2017· article· en· W2771254572 sur OpenAlexfundno aff
Guojun Han, Shih‐Yu Chen, Veronica D. Gonzalez, Eli R. Zunder, Wendy J. Fantl, Garry P. Nolan

Notice bibliographique

RevueCytometry Part A · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFood and Drug AdministrationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHamilton Health Sciences FoundationBill and Melinda Gates FoundationNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésMass cytometryImmunoassayCytometryMultiplexingBismuthFlow cytometryMass spectrometryChemistryChromatographyMolecular biologyMedicineBiologyComputer scienceTelecommunicationsImmunologyBiochemistryPhenotypeAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mass cytometry (or CyTOF) is an atomic mass spectrometry‐based single‐cell immunoassay technology, which has provided an increasingly systematic and sophisticated view in basic biological and clinical studies. Using elemental reporters composed of stable heavy metal isotopes, more than 50 cellular parameters are measured simultaneously. However, this current multiplexing does not meet the theoretical capability of CyTOF instrumentation with 135 detectable channels, primarily due to the limitation of available chemistries for conjugating elemental mass tags to affinity reagents. To address this issue, we develop herein additional metallic mass tag based on bismuth‐209 (209 Bi) for efficient conjugation to monoclonal antibody. This enables the use of an addtional channel m/z = 209 of CyTOF for single‐cell immunoassays. Bismuth has nearly the same charge‐to‐radius ratio as lanthanide elements; thus, bismuth(III) cations (209Bi3+) could coordinate with DTPA chelators in the same geometry of O‐ and N‐donor groups as that of lanthanide. In this report, the coordination chemistry of 209Bi3+ with DTPA chelators and Maxpar® X8 polymers were investigated in details. Accordingly, the protocols of conjugating antibody with bismuth mass tag were provided. A method based on UV‐Vis absorbance at 280 nm of 209Bi3+‐labeling DTPA complexes was developed to evaluate the stoichiometric ratio of 209Bi3+ cations to the conjugated antibody. Side‐by‐side single‐cell analysis experiments with bismuth‐ and lanthanide‐tagged antibodies were carried out to compare the analytical sensitivities. The measurement accuracy of bismuth‐tagged antibody was validated within in vitro assay using primary human natural killer cells. Furthermore, bismuth‐tagged antibodies were successfully employed in cell cycle measurements and high‐dimensional phenotyping immunoassays. © 2017 International Society for Advancement of Cytometry

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCytometry Part AMême sujetSingle-cell and spatial transcriptomicsTravaux en français237 207