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Enregistrement W2771475413 · doi:10.3168/jds.2017-13544

Quantifying fecal shedding of Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis from calves after experimental infection and exposure

2017· article· en· W2771475413 sur OpenAlexafffund
Caroline S. Corbett, Herman W. Barkema, Jeroen De Buck

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDairy Farmers of ManitobaDairy Farmers of CanadaUniversity of Calgary
Mots-clésParatuberculosisFecesInoculationBiologyVeterinary medicineEnteritisAnimal scienceMycobacterium avium subsp. paratuberculosisMycobacteriumMicrobiologyBacteriaImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Johne's disease, a chronic enteritis caused by Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (MAP), causes large economic losses to the dairy industry worldwide. Fecal shedding of MAP contaminates the environment, feed, and water and contributes to new infections on farm, yet there is limited knowledge regarding mechanisms of shedding, extent of intermittent shedding, and numbers of MAP bacteria shed. The objectives were to (1) compare (in an experimental setting) the frequency at which intermittent shedding occurred and the quantity of MAP shed among pen mates that were inoculated or contact-exposed (CE); and (2) determine whether an association existed between inoculation dose and quantity of MAP shed. In the first experiment, 32 newborn Holstein-Friesian bull calves were allocated to pens in groups of 4, whereby 2 calves were inoculated with a moderate dose (MD; 5 × 10 8 cfu) of MAP and 2 calves acted as CE. Calves were group-housed for 3 mo, fecal samples were collected and cultured, and culture-positive samples were quantified. In the second experiment, 6 calves were inoculated with either a low (LD) or high (HD) dose of MAP (1 × 10 8 or 1 × 10 10 cfu, respectively), and fecal samples were collected for 3 mo and cultured for detection of MAP. The amount of MAP was quantified using direct extraction (DE) of DNA from fecal samples and F57-specific quantitative PCR. In experiment 1, the average amount of MAP in all culture-positive samples did not differ between MD and CE calves. In experiment 2, when comparing inoculation doses, LD calves had the lowest proportion of MAP-positive culture samples and HD had the highest, but no difference was detected in the average quantity of MAP shed. This study provided new information in regards to Johne's disease research and control regarding shedding from various inoculation doses and from CE animals; these data should inform future trials and control programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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