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Enregistrement W2771477194 · doi:10.3389/fgene.2017.00189

Post-transcriptional Regulation of PCSK9 by miR-191, miR-222, and miR-224

2017· article· en· W2771477194 sur OpenAlexafffund
Parisa Naeli, Fatemeh Mirzadeh Azad, Mahshid Malakootian, Nabil G. Seidah, Seyed Javad Mowla

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMinistry of Health and Medical EducationFondation Leducq
Mots-clésPCSK9microRNAKexinProprotein convertaseSubtilisinBiologyLuciferaseThree prime untranslated regionTransfectionUntranslated regionGene silencingRegulation of gene expressionMessenger RNACell biologyComputational biologyGeneLDL receptorGeneticsBiochemistryEnzymeCholesterolLipoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since proprotein convertase subtilisin kexin 9 (PCSK9) discovery, a gene involved in LDL metabolism regulation and cardiovascular diseases (CVD), many therapeutic strategies have been introduced for direct targeting of PCSK9. The main goal of these strategies has been to reduce PCSK9 protein level either by application of antibodies or inhibition of its production. In this study, we have tried to discover microRNAs (miRNAs) which can target, and hence regulate, PCSK9 expression. Using bioinformatics tools, we selected three microRNAs with binding sites on 3'-UTR of PCSK9. The expression level of these miRNAs was examined in three different cell lines using real-time RT-PCR. We observed a reciprocal expression pattern between expression level of miR-191, miR-222, and miR-224 with that of PCSK9. Accordingly, the expression levels were highest in Huh7 cells which expressed the lowest level of PCSK9, compared to HepG2 and A549 cell lines. PCSK9 mRNA level also showed a significant decline in HepG2 cells transfected with the vectors overexpressing the aforementioned miRNAs. Furthermore, the miRNAs target sites were cloned in psiCHECK-2 vector, and a direct interaction of the miRNAs and the PCSK9 3'-UTR putative target sites was investigated by means of luciferase assay. Our findings revealed that miR-191, miR-222, and miR-224 can directly interact with PCSK9 3'-UTR and regulate its expression. In conclusion, our data introduces a role for miRNAs to regulate PCSK9 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,426
Score d'incertitude au seuil0,547

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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