APOE allele frequencies in suspected non-amyloid pathophysiology (SNAP) and the prodromal stages of Alzheimer’s Disease
Notice bibliographique
Résumé
Biomarker definitions for preclinical Alzheimer's disease (AD) have identified individuals with neurodegeneration (ND+) without β-amyloidosis (Aβ-) and labeled them with suspected non-AD pathophysiology (SNAP). We evaluated Apolipoprotein E (APOE) ε2 and ε4 allele frequencies across biomarker definitions-Aβ-/ND- (n = 268), Aβ+/ND- (n = 236), Aβ-/ND+ or SNAP (n = 78), Aβ+/ND+ (n = 204)-hypothesizing that SNAP would have an APOE profile comparable to Aβ-/ND-. Using AD Neuroimaging Initiative data (n = 786, 72±7 years, 48% female), amyloid status (Aβ+ or Aβ-) was defined by cerebrospinal fluid (CSF) Aβ-42 levels, and neurodegeneration status (ND+ or ND-) was defined by hippocampal volume from MRI. Binary logistic regression related biomarker status to APOE ε2 and ε4 allele carrier status, adjusting for age, sex, education, and cognitive diagnosis. Compared to the biomarker negative (Aβ-/ND-) participants, higher proportions of ε4 and lower proportions of ε2 carriers were observed among Aβ+/ND- (ε4: OR = 6.23, p<0.001; ε2: OR = 0.53, p = 0.03) and Aβ+/ND+ participants (ε4: OR = 12.07, p<0.001; ε2: OR = 0.29, p = 0.004). SNAP participants were statistically comparable to biomarker negative participants (p-values>0.30). In supplemental analyses, comparable results were observed when coding SNAP using amyloid imaging and when using CSF tau levels. In contrast to APOE, a polygenic risk score for AD that excluded APOE did not show an association with amyloidosis or neurodegeneration (p-values>0.15), but did show an association with SNAP defined using CSF tau (β = 0.004, p = 0.02). Thus, in a population with low levels of cerebrovascular disease and a lower prevalence of SNAP than the general population, APOE and known genetic drivers of AD do not appear to contribute to the neurodegeneration observed in SNAP. Additional work in population based samples is needed to better elucidate the genetic contributors to various etiological drivers of SNAP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».