Regulatory genes coordinating antibiotic‐induced changes in promoter activity and early transcriptional termination of the mycobacterial intrinsic resistance gene <i>whiB7</i>
Notice bibliographique
Résumé
Diseases caused by various Mycobacterium sp., especially Mycobacterium tuberculosis, are a major burden on global health care. Due to high intrinsic antibiotic resistance, treatment options are severely limited. In mycobacteria, WhiB7 coordinates intrinsic resistance to a broad range of antibiotics. While WhiB7 has been established as an auto-regulatory transcriptional activator, the signals and genes needed to induce its expression are poorly understood. Using Mycobacterium smegmatis as a model, we coupled transposon mutagenesis and next generation sequencing with WhiB7-specific antibiotic selection to identify genes that contribute to WhiB7 regulation and function. We showed that whiB7 expression was regulated by two coordinated processes: early termination of the whiB7 transcript and increased whiB7 promoter activity. Early termination was irreversibly maintained by constitutive expression of a putative aspartate aminotransferase gene, MSMEG_4060. A pair of hypothetical genes, MSMEG_3637 and MSMEG_3638, were identified as important contributors to whiB7 promoter induction on antibiotic challenge. Expansion of our understanding of the WhiB7-resistance pathway may lead to identification of inhibitors that allow the use of previously ineffective antibiotics to treat mycobacterial diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».