Manual review of electronic medical records as a reference standard for case definition development: a validation study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The Canadian Primary Care Sentinel Surveillance Network (CPCSSN) previously carried out a validation study of case definitions for 8 chronic diseases (diabetes mellitus, hypertension, osteoarthritis, depression, dementia, chronic obstructive pulmonary disease, parkinsonism and epilepsy) using direct review of "raw" electronic medical record data. Although effective, this method is time-consuming and can present methodological and organizational challenges. We aimed to determine whether the processed and standardized data contained with the CPCSSN database might function as a reference standard for case definition validation. METHODS: Using a traditional validation study design, we compared the case identification results of the chart reviews for the 8 chronic diseases with the results of a manual review of the CPCSSN processed data for the same conditions in the same patient sample. Patients were randomly sampled from the June 30, 2012 CPCSSN database, with oversampling of patients with rare conditions. RESULTS: We analyzed data for 1906 patients. Manual review of the CPCSSN records for case ascertainment yielded sensitivity ranging from 77.5% (95% confidence interval [CI] 73.3%-81.6%) for depression to 97.2% (95% CI 95.4%-99.0%) for diabetes. Specificity was high for all definitions (range 93.1% [95% CI 91.4%-94.7%] to 99.4% [95% CI 99.0%-99.8%]). Positive predictive values and negative predictive values also showed high accuracy of the manual CPCSSN record review relative to review of the raw chart data. INTERPRETATION: The use of CPCSSN records as the reference standard to validate case definitions substantially reduces the burden on sentinel physicians and clinic managers as well as on researchers while offering a reference standard that is a reasonable substitution for chart review.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,253 | 0,376 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,004 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».