Molecular cloning and functional analysis of two novel polygalacturonase genes in <i>Rhizoctonia solani</i>
Notice bibliographique
Résumé
Two novel polygalacturonase (PG) genes, RsPG3 and RsPG4, were cloned from Rhizoctonia solani isolate YN-7, which is a member of anastomosis group (AG) subgroup 1A and causes rice sheath blight. The predicted protein product of RsPG3 contained 239 amino acid (aa) residues, with a molecular mass of 25.0 kD, whereas RsPG4 encoded a deduced protein of 345 aa residues, with a mass of 37.5 kD. Sequence alignment, phylogenetic analysis and gene ontology indicated that RsPG3 and RsPG4 had endo-PG and exo-PG activity, respectively. Recombinant RsPG3 and RsPG4 both exhibited PG activity that led to the destruction of rice sheaths and release of reducing sugars. Pathogenicity assays showed that the two PGs induced tissue necrosis in rice sheaths, indicating that both RsPG3 and RsPG4 are important virulence factors in the R. solani–rice interaction. Further studies are underway to more clearly define the role of these enzymes in rice cell wall degradation and their interaction with PG inhibitor proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».