A single mitochondrial DNA deletion accurately detects significant prostate cancer in men in the PSA ‘grey zone’
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To determine the clinical performance of a blood-based test for clinically significant (CS) prostate cancer (PCa) (grade group ≥ 2) intended for use in men with prostate serum antigen levels in the 'grey zone' (PSA < 10 ng/ml). The test quantifies a previously described 3.4 kb mitochondrial DNA (mtDNA) deletion. METHODS: In a first prospective study of an MRI-guided re-biopsy population (n = 126), the 3.4 kb deletion and 18S rRNA gene were amplified from plasma. A diagnostic threshold was selected from the coordinates of the receiver operating characteristic curve and tested in a second population of men who were (n = 92) biopsy naïve when the mtDNA deletion was assayed and for whom those diagnosed with cancer on initial biopsy were treated with radical prostatectomy. RESULTS: The 3.4 kb deletion was a good predictor of CS PCa in the image-guided re-biopsy population [AUC 0.84, (95% CI 0.73-0.95)] and the selected threshold corresponded to a sensitivity of 87% [95% CI, 70-96%], specificity of 68% [95% CI, 47-85%] and negative predictive value (NPV) of 97%. Applying this threshold to the second population showed this deletion to be a strong predictor of CS cancer [AUC 0.98, (95% CI 0.94-1.02)], independent of PSA or age [sensitivity 100% (95% CI, 93-100%), specificity 90% (95%CI 73-98%) and NPV 100%]. CONCLUSION: The 3.4 kb deletion in plasma is an accurate predictor of CS cancer for men in the PSA 'grey zone'. Used in advance of biopsy for improved patient selection, this deletion may reduce the number of biopsies needed to diagnose CS prostate cancers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».