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Enregistrement W2773386546

Indian hedgehog signaling in osteosarcoma: Co-expression of GLI1, PTCH1, and IHH

2007· article· en· W2773386546 sur OpenAlexaff
Winnie Lo, Jay S. Wunder, Nalan Gökgöz, Robert Parkes, Benjamin A. Alman, Irene L. Andrulis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCyclopamineGLI1SmoothenedIndian hedgehogHedgehog signaling pathwayHedgehogPTCH1PatchedOsteosarcomaBiologyCancer researchInternal medicineEndocrinologySignal transductionMedicineCell biology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1010 Objectives: The Hedgehog (Hh) signaling pathway is crucial in the developmental processes of numerous tissues and organs by influencing the transcription of many target genes. Hedgehog signaling deregulation has been associated with several cancers. Indian Hedgehog (IHH) signals through the transmembrane proteins patched (PTCH) and smoothened (SMO) to activate GLI mediated transcription, including GLI1 and PTCH1. This exerts a feedback mechanism to regulate further IHH signaling. We characterized the expression of IHH, PTCH1, and GLI1 in both osteosarcoma cell lines and primary tumor specimens to determine the activity of Hedgehog signaling in osteosarcoma. The hedgehog antagonist, cyclopamine, was used to determine the proliferative role of hedgehog signaling in osteosarcoma cell lines. Methods: Fresh frozen tumor specimens were obtained from 43 patients with high grade osteosarcoma of the extremity, including 11 who presented with metastases at diagnosis (MetDx), and 32 who had no systemic disease at presentation (NoMetDx). Six osteosarcoma cell lines obtained from ATCC (U-2 OS, Saos-2, MG-63, MNNG/HOS, HOS, and KHOS/NP) were studied. RNA was extracted and real time PCR was used to assess the expression level of IHH, GLI1, and PTCH1. Satterthwaite9s t-test for unequal variance was used for tests comparing outcome groups. Non-parametric tests (Wilcoxon for binary and Jonkheere-Terpstra for continuous variables) were used to assess the association between expression levels and selected clinical and demographic variables. A bromodeoxyuridine incorporation assay was utilized to determine changes in osteosarcoma cell growth upon treatment with cyclopamine. Results: We observed a strong positive association of GLI1, IHH, and PTCH1 with each other. The pairwise correlation coefficient between GLI1 and IHH was +0.442 (p=0.003), between GLI1 and PTCH1 was +0.751 (p Conclusions: We have demonstrated that the expression levels of genes in the Hedgehog pathway are positively correlated with each other. Overexpression of these genes may result in Hedgehog pathway deregulation, which may lead to the progression of osteosarcoma. Cell culture systems are being used to further elucidate the proliferative role of this pathway in osteosarcoma. We are currently investigating the relationship between GLI1, PTCH1, IHH, and survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,437

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,354 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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