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Enregistrement W2773572380 · doi:10.1639/0007-2745-120.4.14

Pseudocyphellaria crocata (Ascomycota: Lobariaceae) in the Americas is revealed to be thirteen species, and none of them is P. crocata

2017· article· en· W2773572380 sur OpenAlexaff
Robert Lücking, Bibiana Moncada, Bruce McCune, Edit Farkas, Bernard Goffinet, Dinah Parker, José Luis Chaves, László Lőkös, Peter R. Nelson, Toby Spribille, Soili Stenroos, Timothy B. Wheeler, Alba Yánez-Ayabaca, Karen L. Dillman, Otto T. Gockman, Trevor Goward, Jason Hollinger, Erin A. Tripp, John Villella, Wilson Ricardo Álvaro Alba, Carlos Julio Arango, Marcela E. S. Cáceres, Luis Fernando Coca, Christian Printzen, Camilo Rodríguez, Klara Scharnagl, Ricardo Rozzi, Edier Soto Medina, L. S. Yakovchenko

Notice bibliographique

RevueThe Bryologist · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLichen and fungal ecology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaRoyal British Columbia MuseumUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonophylyBiologyTaxonLichenBotanyZoologyCladePhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We provide a phylogenetic revision of the Pseudocyphellaria crocata complex in the Americas. Specimens traditionally identified as P. crocata, based on their cyanobacterial photobiont, yellow pseudocyphellae, at least partially white medulla, and yellow soralia or soralia-like structures, are shown to represent 13 distinct species, forming a monophyletic group divided into four large clades, three comprising one species each and one containing eight species, plus two taxa for which no molecular data are available. Seven species correspond to what was previously recognized as P. crocata and one to P. dozyana, whereas a further one is identified as the sorediate counterpart of the usually apotheciate taxon P. lechleri and another as a pseudosorediate morph of the usually phyllidiate species P. neglecta. Surprisingly, none of the species represents P. crocata s.str., which must therefore be excluded from the American lichen biota. The 13 recognized species include three species new to science and three new combinations: P. citrina (Gyeln.) Lücking, Moncada & S.Stenroos, comb. nov. [bas.: Cyanisticta citrina Gyeln., nom. nov. pro Sticta citrina Pers. nom. illeg.], P. desfontainii (Delise) Vain., P. deyi Lücking, sp. nov., P. dozyana (Mont. & Bosch) D.J.Galloway, P. epiflavoides (Gyeln.) Lücking, Farkas & Lőkös, comb. nov. [bas.: Cyanisticta epiflavoides Gyeln.], P. hawaiiensis H.Magn., P. hillii (C.W.Dodge) D.J.Galloway, P. holarctica McCune, Lücking & Moncada, sp. nov., P. lechleri (Müll. Arg.) Du Rietz, P. neglecta (Müll. Arg.) H.Magn., P. punctata Lendemer, Lücking & Moncada sp. nov., P. sandwicensis (Zahlbr.) Moncada & Lücking, comb. nov. [bas.: Sticta crocata f. sandwicensis Zahlbr.], and P. xanthosticta (Pers.) Moncada & Lücking. Based on sequenced specimens, a neotype is selected for P. citrina and epitypes for P. hawaiiensis, P. lechleri, P. sandwicensis and P. xanthosticta. A key to all sorediate or pseudosorediate species of this complex in the Americas is presented, and all species are described, discussed and illustrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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