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Enregistrement W2773618384 · doi:10.1016/j.celrep.2017.11.021

Convergence of BMI1 and CHD7 on ERK Signaling in Medulloblastoma

2017· article· en· W2773618384 sur OpenAlexaff
Sara Badodi, Adrian M. Dubuc, Xinyu Zhang, Gabriel Rosser, Mariane da Cunha Jaeger, Michelle Kameda-Smith, Anca Sorana Morrissy, Paul Guilhamon, Philipp Suetterlin, Xiao‐Nan Li, Loredana Guglielmi, Ashirwad Merve, Hamza Farooq, Mathieu Lupien, Sheila K. Singh, M. Albert Basson, Michael D. Taylor, Silvia Marino

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchMcMaster Children's HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilBrain Tumour ResearchMinistério da EducaçãoNational Institute for Health and Care ResearchCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorPathological Society of Great Britain and Ireland
Mots-clésBMI1MedulloblastomaPsychological repressionMAPK/ERK pathwayBiologyCancer researchConvergence (economics)ChromatinCell biologySignal transductionGeneticsGene expressionStem cellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe molecular convergence between BMI1 and CHD7 in the initiation of medulloblastoma. Identified in a functional genomic screen in mouse models, a BMI1 High ;CHD7 Low expression signature within medulloblastoma characterizes patients with poor overall survival. We show that BMI1-mediated repression of the ERK1/2 pathway leads to increased proliferation and tumor burden in primary human MB cells and in a xenograft model, respectively. We provide evidence that repression of the ERK inhibitor DUSP4 by BMI1 is dependent on a more accessible chromatin configuration in G4 MB cells with low CHD7 expression. These findings extend current knowledge of the role of BMI1 and CHD7 in medulloblastoma pathogenesis, and they raise the possibility that pharmacological targeting of BMI1 or ERK may be particularly indicated in a subgroup of MB with low expression levels of CHD7.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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