C1q-Binding DSA Induce Distinct Molecular Phenotypes in Kidney Transplant Biopsies.
Notice bibliographique
Résumé
Background Complement binding DSA associates with risk of kidney allograft loss. We used the molecular microscope system in kidney transplant biopsies performed in DSA+ patients and investigated the molecular phenotypes according to the complement binding capacity of circulating DSA. Methods We enrolled 628 kidney transplant recipients, and assessed patients with DSA detected in the first year post-TX (n=154). All DSA+ patients were tested for C1q-binding using single-antigen beads. All patients had a biopsy performed at the time of sera evaluation. Microarray-based gene expression was assessed using relevant molecular measurements including pathogenesis-based transcript sets (PBTs): ABMR molecular Score, endothelial DSA-selective transcripts (eDSAST), macrophage associated transcripts (QCMAT), gamma-interferon response (GRIT), injury-repair response transcripts (IRRAT) and complement regulated genes (KEGGDE). Results Among the 154/628 (24.5%) patients with post-TX DSA, we identified 48 (31.2%) patients with C1q+ DSA and 106 (68.8.%) patients with C1q-neg DSA. As compared to C1q-neg DSA, patients with C1q+ DSA had higher mean Banff scores for microcirculation inflammation (1.2 vs 2.8), TG (0.13 vs 0.41) and higher rate of C4d deposition (14% vs 58%, p<0.001 for all comparisons). Gene expression analysis revealed that patients with C1q+ DSA had higher ABMR molecular Score (p=0.0032), higher expression of eDSAST (p=0.0273), QCMAT (p=0.0014), GRIT (p=0.020) and IRRAT (p=0.00072) as compared to patients with C1q-neg DSA. Many complement transcripts showed higher expression in biopsies from patients with C1q+ DSA including C3aR and C5aR (p=0.0034 and 0.011) and other complement components C1QA and B, C2, C3. Assessment in a primary human cell panel showed that complement receptor expression was restricted to macrophages while the top complement genes reflected IFN-g induction in macrophages. Conclusion Patients with C1q+DSA show a distinct phenotype characterized by higher expression of genes related to endothelial activation, injury and evidence for higher expression of genes related to classical complement activation with many reflecting macrophage activation. This study provides a link between in vitro capacity of DSA to bind C1q and their ability to induce specific allograft injury. DISCLOSURE:Halloran, P.: Other, Astellas, Lecturing, Novartis, Lecturing, One Lambda, Lecturing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».