Analysis of Membrane Protein Interactions with a Bacterial Adenylate Cyclase–Based Two‐Hybrid (BACTH) Technique
Notice bibliographique
Résumé
The bacterial two-hybrid (BACTH, for "Bacterial Adenylate Cyclase-based Two-Hybrid") technique is a simple and fast genetic approach to analyze protein-protein interactions in vivo. In this system, the proteins of interest are genetically fused to two complementary fragments from the catalytic domain of Bordetella pertussis adenylate cyclase and co-expressed in strains of Escherichia coli deficient in adenylate cyclase. Association of the hybrid proteins restores synthesis of cyclic AMP (cAMP), which then triggers the expression of catabolic operons such as the lactose operon or the maltose regulon. As BACTH uses a cAMP second messenger, the association between the chimeric proteins can take place at a distance from the transcription machinery. This technique is therefore particularly appropriate for studying interactions involving integral-membrane or membrane-associated proteins that may not be soluble in the cytoplasm, and/or that may only associate in the plane of the membrane. This unit describes the basic procedures to characterize protein-protein interactions with the BACTH genetic system and to search for potential partners of known proteins. © 2017 by John Wiley & Sons, Inc.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».