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Enregistrement W2774724069 · doi:10.1097/00007890-201407151-03037

Peritubular Capillary Vessels and Hypoxia/Angiogenesis Genes in Kidney Biopsies With Transplant Glomerulopathy.

2014· article· en· W2774724069 sur OpenAlexaff
Ana Konvalinka, Roger John, Paul C. Boutros, J. Kim, S. Yang, J. W. Scholey, Andrew M. Herzenberg, Heidi Reich

Notice bibliographique

RevueTransplantation · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal and Vascular Pathologies
Établissements canadiensToronto General HospitalOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeritubular capillariesHypoxia (environmental)PathologyPathogenesisMedicineKidneyAngiogenesisCD68TransplantationFibrosisCD31Internal medicineImmunohistochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Transplant glomerulopathy (TG) is an important cause of late renal allograft loss. TG has been linked to the presence of alloantibodies, chronic rejection, and persistent inflammation, however the mechanisms responsible for TG are incompletely understood. Peritubular capillary (PTC) loss and hypoxia contribute to pathogenesis of chronic rejection in experimental lung transplantation. In these models HIF1A gene upregulation in response to hypoxia contributes to microvascular repair. A role for PTC loss and hypoxia-related gene expression has not been examined in TG. While persistent inflammation is implicated in TG-mediated graft injury it is not known whether this reflects downstream effects of PTC loss. To study the role of PTC loss in the pathogenesis of TG we quantified PTC density, and evaluated expression of hypoxia-associated and inflammatory pathways in kidney biopsies of patients with TG compared to acute antibody-mediated rejection (AMR) and interstitial fibrosis/tubular atrophy not otherwise specified (IFTA NOS). METHODS: We utilized custom Taqman Low Density Arrays (TLDA) designed to measure expression of 48 genes in pathways of interest in archived kidney biopsies for cause. Formalin-fixed paraffin embedded sections were stained with antibody to CD31, an endothelial cell marker for detection of microvessel density. PTC leukocytes were immunophenotyped in TG cases. RESULTS: Among 19 cases of TG, 16 of IFTA NOS, and 10 of AMR, we found significant differences in the expression of VCAM1, CCL5, CCL2 and IFNg in TG compared to AMR and IFTA NOS. CD68 (monocyte marker) was most elevated in AMR, and the lowest in IFTA NOS. Hypoxia/angiogenesis genes (HIF1A, VEGFA and EDN1) were increased in AMR with no significant difference between TG and IFTA NOS. Peritubular capillary density was comparable in TG and other groups. The majority of PTC leukocytes in TG were macrophages and T cells. CONCLUSIONS: Inflammation is a prominent finding in TG biopsies, and macrophages and T cells appear to be important mediators. We found no evidence of prominent PTC drop out or hypoxia responses in TG. Neither PTC drop out nor hypoxia appear important in established TG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,487
Score d'incertitude au seuil0,495

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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