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Enregistrement W2775442832 · doi:10.1016/j.neuron.2018.08.039

An Open Resource for Non-human Primate Imaging

2018· article· en· W2775442832 sur OpenAlexafffund
Michael P. Milham, Lei Ai, Bonhwang Koo, Ting Xu, Céline Amiez, Fabien Balezeau, Mark G. Baxter, Erwin L. A. Blezer, Thomas Brochier, Aihua Chen, Paula L. Croxson, Christienne G. Damatac, Stanislas Dehaene, Stefan Everling, Damian A. Fair, Lazar Fleysher, Winrich A. Freiwald, Seán Froudist‐Walsh, Timothy D. Griffiths, Carole Guedj, Fadila Hadj‐Bouziane, Suliann Ben Hamed, Noam Harel, Bassem Hiba, Béchir Jarraya, Benjamin Jung, Sabine Kästner, P. Christiaan Klink, Sze Chai Kwok, Kevin N. Laland, David A. Leopold, Patrik Lindenfors, Rogier B. Mars, Ravi S. Menon, Adam Messinger, Martine Meunier, Kelvin Mok, John H. Morrison, Jennifer Nacef, Jamie Nagy, Michael Ortiz-Rios, Christopher I. Petkov, Mark A. Pinsk, Colline Poirier, Emmanuel Procyk, Reza Rajimehr, Simon M. Reader, Pieter R. Roelfsema, David A. Rudko, Matthew F. S. Rushworth, Brian E. Russ, Jérôme Sallet, Michael C. Schmid, Caspar M. Schwiedrzik, Jakob Seidlitz, Julien Sein, Amir Shmuel, Elinor L. Sullivan, Leslie G. Ungerleider, Alexander Thiele, Orlin S. Todorov, Doris Y. Tsao, Zheng Wang, Charles Wilson, Essa Yacoub, Frank Q. Ye, Wilbert Zarco, Yong‐Di Zhou, Daniel S. Margulies, Charles E. Schroeder

Notice bibliographique

RevueNeuron · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalWestern University
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Institute on AgingMedical Research CouncilNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthFondation de FranceScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityDirectorate for Biological SciencesShanghai Municipal Education CommissionJohn Templeton FoundationNational Natural Science Foundation of ChinaNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Centre for the Replacement, Refinement and Reduction of Animals in ResearchFondation Brain CanadaEuropean CommissionNatural Science Foundation of ShanghaiNewcastle UniversityUniversity of OxfordMcKnight FoundationFondation NeurodisNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekAgence Nationale de la RechercheBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome TrustChild Mind InstituteIcahn School of Medicine at Mount SinaiNew York Stem Cell FoundationMax-Planck-GesellschaftRoyal SocietyUniversity of MinnesotaNational Science FoundationNational Institute of Mental HealthFondation pour la Recherche MédicaleMcGill UniversityInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleBRAIN Initiative
Mots-clésNon human primateNeuroimagingPrimateData scienceComputer scienceData sharingNeurosciencePsychologyMedicineBiologyEvolutionary biologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-human primate neuroimaging is a rapidly growing area of research that promises to transform and scale translational and cross-species comparative neuroscience. Unfortunately, the technological and methodological advances of the past two decades have outpaced the accrual of data, which is particularly challenging given the relatively few centers that have the necessary facilities and capabilities. The PRIMatE Data Exchange (PRIME-DE) addresses this challenge by aggregating independently acquired non-human primate magnetic resonance imaging (MRI) datasets and openly sharing them via the International Neuroimaging Data-sharing Initiative (INDI). Here, we present the rationale, design, and procedures for the PRIME-DE consortium, as well as the initial release, consisting of 25 independent data collections aggregated across 22 sites (total = 217 non-human primates). We also outline the unique pitfalls and challenges that should be considered in the analysis of non-human primate MRI datasets, including providing automated quality assessment of the contributed datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,035
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,995
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,035
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,008
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0050,011
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1190,080

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,424
Écart entre enseignants0,387 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations282
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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