Alphaherpesvirus: Isolation, Identification, Partial Characterisation, Associated Pathologic Findings and Epidemiology in Beluga Whales (Delphinapterus leucas) in Alaska and Arctic Canada
Notice bibliographique
Résumé
Live, dead stranded, and harvested belugas (Delphinapterus leucas) in Alaska and the western Canadian Arctic were screened for viruses utilizing a primary beluga cell line. Samples consisted of swabs from blowhole, anus, and genital tract. Virus cytopathic effect was seen after the incubation of 6–30 days post infection, and virus-like particles consistent with herpesvirus were observed upon electron microscopy. DNA extraction, cetacean-specific polymerase chain reaction (PCR) amplification, and sequencing of the DNA-dependent DNA polymerase gene fragments of approximately 700 nucleotides revealed the presence of a new species of alphaherpesvirus. Culture positive isolates were recovered from all swab types, from 2001 to 2016. PCR testing of swab and skin lesions from Bristol Bay, Alaska belugas revealed that the herpesvirus was present in the blowholes of a high proportion of the animals. Results suggest that belugas from Canadian and Alaskan locations are infected with alphaherpesvirus. Eight culture-positive belugas were identified from Alaska, all but one were adults and all had evidence of skin disease. No Canadian belugas showed signs of skin disease. Virus was isolated from three separate populations indicating it is likely enzootic in belugas. This is the first report of an alphaherpesvirus isolated and propagated from a monodontid species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».