MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W27759386 · doi:10.1021/acsinfecdis.6b00090

COMPARATIVE STUDY OF FIVE FILTER TYPES FOR STORMWATER TREATMENT : USING A WHOLE EFFLUENT ASSESSMENT APPROACH TO EVALUATE FILTER PERFORMANCE

2013· article· en· W27759386 sur OpenAlexfundno aff
Veronica Ribé, Emma Nehrenheim, Peter Carlsson, Peder Eneroth, Monica Odlare

Notice bibliographique

RevueACS Infectious Diseases · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHeavy metals in environment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesStructural Genomics ConsortiumCanadian Institutes of Health ResearchNational Research FoundationWellcome TrustCongressionally Directed Medical Research ProgramsLouisiana Board of Regents
Mots-clésFilter (signal processing)EffluentStormwaterEnvironmental scienceComputer scienceEnvironmental engineeringSurface runoffComputer vision

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The potent antistaphylococcal activity of N-substituted pantothenamides (PanAms) has been shown to at least partially be due to the inhibition of Staphylococcus aureus's atypical type II pantothenate kinase (SaPanK<sub>II</sub>), the first enzyme of coenzyme A biosynthesis. This mechanism of action follows from SaPanK<sub>II</sub> having a binding mode for PanAms that is distinct from those of other PanKs. To dissect the molecular interactions responsible for PanAm inhibitory activity, we conducted a mini SAR study in tandem with the cocrystallization of SaPanK<sub>II</sub> with two classic PanAms (N5-Pan and N7-Pan), culminating in the synthesis and characterization of two new PanAms, N-Pip-PanAm and MeO-N5-PanAm. The cocrystal structures showed that all of the PanAms are phosphorylated by SaPanK<sub>II</sub> but remain bound at the active site; this occurs primarily through interactions with Tyr240' and Thr172'. Kinetic analysis showed a strong correlation between k<sub>cat</sub> (slow PanAm turnover) and IC<sub>50</sub> (inhibition of pantothenate phosphorylation) values, suggesting that SaPanK<sub>II</sub> inhibition occurs via a delay in product release. In-depth analysis of the PanAm-bound structures showed that the capacity for accepting a hydrogen bond from the amide of Thr172' was a stronger determinant for PanAm potency than the capacity to π-stack with Tyr240'. The two new PanAms, N-Pip-PanAm and MeO-N5-PanAm, effectively combine both hydrogen bonding and hydrophobic interactions, resulting in the most potent SaPanK<sub>II</sub> inhibition described to date. Taken together, our results are consistent with an inhibition mechanism wherein PanAms act as SaPanK<sub>II</sub> substrates that remain bound upon phosphorylation. The phospho-PanAm-SaPanK<sub>II</sub> interactions described herein may help future antistaphylococcal drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,467
Score d'incertitude au seuil0,891

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueACS Infectious DiseasesMême sujetHeavy metals in environmentTravaux en français237 207