Inducing protective antibody response to HIV-1 with inner domain of gp120
Notice bibliographique
Résumé
Recent nonhuman primate studies and clinical trials suggest that antibody-mediated protection against HIV-1 will require anti-envelope (Env) humoral immunity beyond direct neutralization, to include Fc-receptor effector functions such as antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC).In parallel, strong evidence points toward the transitional and non-neutralizing A32-like epitopes (Cluster A) of HIV-1 Env as major targets for potent ADCC responses.We were first to define these epitope targets at atomic level by describing structures of several A32-like antibodies in complexes with CD4-triggered gp120.Our studies mapped the A32-epitope into mobile layers 1 and 2 of the inner domain (ID) of CD4-triggered gp120.Here, we describe a stable molecule expressing the C1-C2 region epitopes within a minimal structural unit of HIV-1 Env.Through two phases of structure-based design we developed a construct, referred to as ID2, which consists of the inner domain of gp120 expressed independently of the outer domain and stabilized in the CD4-bound conformation by an inter-layer disulfide bond.Each phase of the design process was visualized and validated at the molecular level by structural analysis of ID variants complexed with anti-Cluster A antibodies as well as by functional testing.Our data indicate that ID2 expresses the C1-C2 epitopes involved in potent ADCC within the context of a CD4triggered full-length gp120, but without the complication of other epitope regions.Thus, ID2 represents a novel candidate probe for the analysis and/or selective induction of antibody responses to the A32 epitope sub-region.We also present the crystal structure of ID2 complexed with mAb A32, the canonical antibody of the Cluster A region.This represents the first structural analysis of mAb A32 bound by its Env antigen defining its epitope.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».