MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2777281989 · doi:10.1038/ajg.2017.471

Prediction of Fungal Infection Development and Their Impact on Survival Using the NACSELD Cohort

2017· article· en· W2777281989 sur OpenAlexaff
Jasmohan S. Bajaj, K. Rajender Reddy, Puneeta Tandon, Florence Wong, Patrick S. Kamath, Scott W. Biggins, Guadalupe García–Tsao, Michael B. Fallon, Benedict Maliakkal, Jennifer C. Lai, Hugo E. Vargas, Ram Subramanian, Paul J. Thuluvath, Leroy R. Thacker, Jacqueline G. O’Leary

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSpontaneous bacterial peritonitisCirrhosisInternal medicineFungemiaCase fatality rateCohortIntensive care unitPeritonitisIntensive care medicineImmunologyMycosisEpidemiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Bacterial infections are associated with negative outcomes in cirrhosis but fungal infections are being increasingly recognized. The objective of this study is to define risk factors for fungal infection development and impact on 30-day survival. METHODS: In a large, multi-center cirrhotic inpatient cohort, demographics, cirrhosis details, intensive care unit (ICU), organ failures/acute-on-chronic liver failure (ACLF), and 30-day survival were compared between patients without infections and with bacterial infections alone, with those with fungal infections. Variables associated with fungal infection development were determined using multi-variable regression. Ordinal variables (0=no infection, 1=community-acquired bacterial infection, 2=nosocomial bacterial, and 3=fungal infection) were input into a 30-day survival model. RESULTS: A total of 2,743 patients (1,691 no infection, 918 bacterial, and 134 fungal infections) were included. Patients with fungal infection, all of which were nosocomial, were more likely to be admitted with bacterial infections, on spontaneous bacterial peritonitis prophylaxis, and have diabetes and advanced cirrhosis. Bacterial infection types did not predict risk for fungal infections. Multi-variable analysis showed male gender to be protective, whereas diabetes, longer stay, ICU admission, acute kidney injury (AKI), and admission bacterial infection were associated with fungal infection development (area under the curve (AUC)=0.82). Fungal infections were associated with significantly higher ACLF, inpatient stay, ICU admission, and worse 30-day survival. The case fatality rate was 30% with most fungal infections but >50% for fungemia and fungal peritonitis. On a multi-variable analysis, age, AKI, model for end-stage liver disease, ICU admission, and ordinal infection variables impaired survival (P<0.0001, AUC=0.83). CONCLUSIONS: Fungal infections are associated with a poor 30-day survival in hospitalized cirrhotic patients compared with uninfected patients, and those with bacterial infections. Patients with diabetes, AKI, and those with an admission bacterial infection form a high-risk subgroup.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe American Journal of GastroenterologyMême sujetAntifungal resistance and susceptibilityTravaux en français237 207