MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2777769444 · doi:10.1002/prca.201700143

Understanding TGEV–ETEC Coinfection through the Lens of Proteomics: A Tale of Porcine Diarrhea

2017· letter· en· W2777769444 sur OpenAlexafffund
Guillermo Arango Duque, Hamlet Acevedo Ospina

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS - CLINICAL APPLICATIONS · 2017
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDiarrheaCoinfectionVirologyMicrobiologyBiologyMedicinePathologyHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Porcine diarrhea and gastroenteritis are major causes of piglet mortality that result in devastating economic losses to the industry. A plethora of pathogens can cause these diseases, with the transmissible gastroenteritis virus (TGEV) and enterotoxigenic Escherichia coli K88 (ETEC) being two of the most salient. In the December 2017 issue of Proteomics Clinical Aplications, Xia and colleagues used comparative proteomics to shed light on how these microbes interact to cause severe disease . The authors discovered that TGEV induces an epithelial-mesenchymal transition-like phenotype that augments cell adhesion proteins mediating the attachment of ETEC to intestinal epithelial cells. Moreover, coinfection was found to modulate several host proteins that could bolster pathogen persistence. Importantly, the authors observed that ETEC suppresses the production of inflammatory cytokines induced by TGEV, which may in turn promote the long-term survival of both microbes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0180,024
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,286
Tête enseignante GPT0,434
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePROTEOMICS - CLINICAL APPLICATIONSMême sujetViral gastroenteritis research and epidemiologyTravaux en français237 207