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Enregistrement W2778612823 · doi:10.1186/s13073-017-0505-2

B3GALNT2 mutations associated with non-syndromic autosomal recessive intellectual disability reveal a lack of genotype–phenotype associations in the muscular dystrophy-dystroglycanopathies

2017· article· en· W2778612823 sur OpenAlexfundno aff
Reza Maroofian, Moniek Riemersma, Lucas T. Jae, Narges Zhianabed, Marjolein H. Willemsen, W.M. Wissink-Lindhout, Michèl A.A.P. Willemsen, Arjan P.M. de Brouwer, Mohammad Yahya Vahidi Mehrjardi, Mahmoud Reza Ashrafi, Benno Küsters, Tjitske Kleefstra, Yalda Jamshidi, Mojila Nasseri, Rolph Pfundt, Thijn R. Brummelkamp, Mohammad Reza Abbaszadegan, Dirk J. Lefeber, Hans van Bokhoven

Notice bibliographique

RevueGenome Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRadboud Universitair Medisch CentrumSwansea UniversityNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekRadboud UniversiteitZonMwPrinses Beatrix SpierfondsRare Disease Foundation
Mots-clésMuscular dystrophyPhenotypeCompound heterozygosityGeneticsExome sequencingCongenital muscular dystrophyHaploinsufficiencyMedicineMuscle biopsyLimb-girdle muscular dystrophyIntellectual disabilityGenetic heterogeneityFacioscapulohumeral muscular dystrophyBiologyPathologyGeneBiopsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The phenotypic severity of congenital muscular dystrophy-dystroglycanopathy (MDDG) syndromes associated with aberrant glycosylation of α-dystroglycan ranges from the severe Walker-Warburg syndrome or muscle-eye-brain disease to mild, late-onset, isolated limb-girdle muscular dystrophy without neural involvement. However, muscular dystrophy is invariably found across the spectrum of MDDG patients. METHODS: Using linkage mapping and whole-exome sequencing in two families with an unexplained neurodevelopmental disorder, we have identified homozygous and compound heterozygous mutations in B3GALNT2. RESULTS: The first family comprises two brothers of Dutch non-consanguineous parents presenting with mild ID and behavioral problems. Immunohistochemical analysis of muscle biopsy revealed no significant aberrations, in line with the absence of a muscular phenotype in the affected siblings. The second family includes five affected individuals from an Iranian consanguineous kindred with mild-to-moderate intellectual disability (ID) and epilepsy without any notable neuroimaging, muscle, or eye abnormalities. Complementation assays of the compound heterozygous mutations identified in the two brothers had a comparable effect on the O-glycosylation of α-dystroglycan as previously reported mutations that are associated with severe muscular phenotypes. CONCLUSIONS: In conclusion, we show that mutations in B3GALNT2 can give rise to a novel MDDG syndrome presentation, characterized by ID associated variably with seizure, but without any apparent muscular involvement. Importantly, B3GALNT2 activity does not fully correlate with the severity of the phenotype as assessed by the complementation assay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,806
Score d'incertitude au seuil0,495

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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