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Enregistrement W2779404956 · doi:10.9778/cmajo.20170072

Case–control study of household contacts to examine immunological protection from<i>Bordetella pertussis</i>transmission — study protocol

2017· article· en· W2779404956 sur OpenAlexaffvenueabout
Shelly Bolotin, Caitlin Johnson, Susan Quach, Ardith Ambrose, Sarah DeCoutere, Shelley L. Deeks, Steven J. Drews, Amna Faheem, Karen Green, Scott A. Halperin, Linda Hoang, Frances Jamieson, Tobias R. Kollmann, Alex Marchand‐Austin, Deirdre McCormack, Allison McGeer, Michelle Murti, Alison Orth, Anu Rebbapragada, Otto G. Vanderkooi, Jun Wang, Bryna Warshawsky, Natasha S. Crowcroft

Notice bibliographique

RevueCMAJ Open · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteProvincial Laboratory of Public HealthPublic Health OntarioBC Centre for Disease ControlMcGill University Health CentreBrampton Civic HospitalMount Sinai HospitalUniversity of CalgaryFraser HealthUniversity of AlbertaUniversity of TorontoDalhousie University
Organismes subventionnairesSanofi PasteurSanofiGlaxoSmithKline
Mots-clésBordetella pertussisImmunologyMedicineTransmission (telecommunications)Whooping coughPertussis vaccineImmune systemImmunityBiologyVaccinationImmunization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: There is mounting evidence that the recent resurgence of pertussis in many countries is in part related to the acellular vaccine, which has been administered in Canada since 1997. This vaccine elicits a different cell-mediated immune response than the previously used whole-cell vaccine, and its effectiveness wanes over time. The aim of this study is to understand the immunological, demographic and clinical factors that mediate protection from pertussis on exposure. Methods: This is a household case-control study protocol. Following notification of an index case in a household, a study team will conduct a home visit to collect data and biological specimens. The study team will return to the household 8 weeks from the onset of illness in the index case. The Th1, Th2 and Th17 responses, cytokine expression, IgG subclass, blood cell counts and presence of Bordetella pertussis will be determined. We will use laboratory and statistical analyses to determine immunological differences between contacts who are infected with B. pertussis and contacts who remain healthy, and to determine which clinical and demographic covariates are associated with a reduced risk of infection. Interpretation: The results of this study will be essential for understanding the immune response required for protection from infection with B. pertussis and will contribute to our understanding of the shortcomings of the current vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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