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Enregistrement W2779612734 · doi:10.1097/fpc.0000000000000318

Genome-wide meta-analyses identifies novel taxane-induced peripheral neuropathy-associated loci

2017· review· en· W2779612734 sur OpenAlexaff
Lara E. Sucheston‐Campbell, Alyssa Clay‐Gilmour, William E. Barlow, G. Thomas Budd, Daniel O. Stram, Christopher A. Haiman, Xin Sheng, Li Yan, Gary Zirpoli, Song Yao, Chen Jiang, Kouros Owzar, Dawn L. Hershman, Kathy S. Albain, Daniel F. Hayes, Halle C. F. Moore, Timothy J. Hobday, James A. Stewart, Abbas Rizvi, Claudine Isaacs, Muhammad Salim, Jule R. Gralow, Gabriel N. Hortobágyi, Robert B. Livingston, Deanna L. Kroetz, Christine B. Ambrosone

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2017
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Treatment and Pharmacology
Établissements canadiensSaskatchewan Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésTaxaneMedicineChemotherapy-induced peripheral neuropathyPeripheral neuropathyInternal medicineOncologyOdds ratioCommon Terminology Criteria for Adverse EventsBreast cancerGenome-wide association studyConfidence intervalCancerPharmacogeneticsDiabetes mellitusGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGenotypeBiologyGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Taxane containing chemotherapy extends survival for breast cancer patients. However, taxane-induced peripheral neuropathy (TIPN) cannot be predicted, prevented or effectively treated. Using genome-wide analyses, we sought to identify common risk variants for TIPN. PATIENTS AND METHODS: Women with high-risk breast cancer enrolled in SWOG 0221 were genotyped using the Illumina 1M chip. Genome-wide analyses were performed in relation to ≥grade 3 Common Terminology Criteria for Adverse Events (CTCAE) neuropathy in European and African Americans. Data were meta-analyzed with GW associations of CTCAE ≥grade 3 versus

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,015
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,450
Tête enseignante GPT0,487
Écart entre enseignants0,037 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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