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Enregistrement W2779666414 · doi:10.3389/fpls.2017.02175

Arabidopsis Calmodulin-Like Proteins, CML15 and CML16 Possess Biochemical Properties Distinct from Calmodulin and Show Non-overlapping Tissue Expression Patterns

2017· article· en· W2779666414 sur OpenAlex
Adenike Ogunrinde, Kim Munro, A L Davidson, Ubaid Midhat, Wayne A. Snedden

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCalmodulinArabidopsisCalciumIsothermal titration calorimetryBiologySecond messenger systemBiochemistrySignal transductionCalcium signalingCell biologyArabidopsis thalianaAbiotic stressChemistryGeneEnzymeMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium ions are used as ubiquitous, key second messengers in cells across eukaryotic taxa. In plants, calcium signal transduction is involved in a wide range of cellular processes from abiotic and biotic stress responses to development and growth. Calcium signals are detected by calcium sensor proteins, of which calmodulin (CaM), is the most evolutionarily conserved and well studied. These sensors regulate downstream targets to propagate the information in signaling pathways. Plants possess a large family of calcium sensors related to CaM, termed CaM-like (CMLs), that are not found in animals and remain largely unstudied at the structural and functional level. Here, we investigated the biochemical properties and gene promoter activity of two closely related members of the Arabidopsis CML family, CML15 and CML16. Biochemical characterization of recombinant CML15 and CML16 indicated that they possess properties consistent with their predicted roles as calcium sensors. In the absence of calcium, CML15 and CML16 display greater intrinsic hydrophobicity than CaM. Both CMLs displayed calcium-dependent and magnesium-independent conformational changes that expose hydrophobic residues, but the degree of hydrophobic exposure was markedly less than that observed for CaM. Isothermal titration calorimetry indicated two and three calcium-binding sites for CML15 and CML16, respectively, with affinities expected to be within a physiological range. Both CML15 and CML16 bound calcium with high affinity in the presence of excess magnesium. Promoter-reporter analysis demonstrated that the CML16 promoter is active across a range of Arabidopsis tissues and developmental stages, whereas the CML15 promoter activity is very restricted and was observed only in floral tissues, specifically anthers and pollen. Collectively, our data indicate that these CMLs behave biochemically like calcium sensors but with properties distinct from CaM and likely have non-overlapping roles in floral development. We discuss our findings in the broader context of calcium sensors and signaling in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,783

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle