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Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks
Florence Démenais, Patricia Margaritte‐Jeannin, Kathleen C. Barnes, William Cookson, Janine Altmüller, Wei Ang, R. Graham Barr, Terri H. Beaty, Allan B. Becker, John Beilby, Hans Bisgaard, Unnur Steina Björnsdóttir, Eugene R. Bleecker, Klaus Bønnelykke, Dorret I. Boomsma, Emmanuelle Bouzigon, Christopher E. Brightling, Myriam Brossard, Guy Brusselle, Esteban G. Burchard, Kristin M. Burkart, Andrew Bush, Moira Chan‐Yeung, Kian Fan Chung, Alexessander Couto Alves, John A. Curtin, Adnan Čustović, Denise Daley, Johan C. de Jongste, Blanca E. Del-Río-Navarro, Kathleen Donohue, Liesbeth Duijts, Celeste Eng, Johan G. Eriksson, Martin Farrall, Yu. Yu. Fedorova, Bjarke Feenstra, Manuel A. R. Ferreira, Maxim B. Freidin, Zofia K. Z. Gajdos, Jim Gauderman, Ulrike Gehring, Frank Geller, Jon Genuneit, Sina A. Gharib, Frank D. Gilliland, Raquel Granell, Penelope E. Graves, Daníel F. Guðbjartsson, Tari Haahtela, Susan R. Heckbert, Dick Heederik, Joachim Heinrich, Markku Heliövaara, John Henderson, Blanca E. Himes, Hiroshi Hirose, Joel N. Hirschhorn, Albert Hofman, Patrick G. Holt, Thomas J. Hudson, Jennie Hui, Medea Imboden, В. П. Иванов, Vincent W. V. Jaddoe, Christer Janson, Marjo‐Riitta Järvelin, Deborah Jarvis, Graham Jones, Ingileif Jónsdóttir, Michael Kabesch, Mika Kähönen, David B. Kantor, А. С. Карунас, Э. К. Хуснутдинова, Gerard H. Koppelman, Anita L. Kozyrskyj, Eskil Kreiner, Michiaki Kubo, Rajesh Kumar, Ashish Kumar, Mikko Kuokkanen, Lies Lahousse, Tarja Laitinen, Catherine Laprise, Mark Lathrop, Susanne Lau, Youngae Lee, Terho Lehtimäki, Sébastien Letort, Albert M. Levin, Li Guo, Liming Liang, Laura R. Loehr, Stephanie J. London, Daan W. Loth, Ani Manichaikul, Ingo Marenholz, Fernando J. Martínez, Melanie C. Matheson, Rasika A. Mathias, Kenji Matsumoto, Hamdi Mbarek, Wendy L. McArdle, Mads Melbye, Erik Melén, Deborah A. Meyers, Sven Michel, Hamida Mohamdi, Arthur W. Musk, Rachel A. Myers, Maartje A. E. Nieuwenhuis, Emiko Noguchi, George O'connor, Л. М. Огородова, Cameron D. Palmer, Aarno Palotie, Julie E. Park, Craig E. Pennell, Göran Pershagen, Alexey Polonikov, Dirkje S. Postma, Nicole Probst‐Hensch, В. П. Пузырев, Benjamin A. Raby, Olli T. Raitakari, Adaikalavan Ramasamy, Stephen S. Rich, Colin F. Robertson, Isabelle Romieu, Muhammad T. Salam, Veikko Salomaa, Vivi Schlünssen, Robert A. Scott, П. А. Селиванова, Torben Sigsgaard, Angela Simpson, Valérie Siroux, Lewis J. Smith, Maria Solodilova, Marie Standl, David P. Strachan, Bruno H. Stricker, Atsushi Takahashi, Philip J. Thompson, Guðmar Þorleifsson, Unnur Þorsteinsdóttir, Carla M. T. Tiesler, Dara G. Torgerson, Tatsuhiko Tsunoda, André G. Uitterlinden, Ralf J.P. van der Valk, Amaury Vaysse, Sailaja Vedantam, Andrea von Berg, Erika von Mutius, Judith M. Vonk, Johannes Waage, Scott T. Weiss, Wendy White, Magnus Wickman, Elisabeth Widén, Gonneke Willemsen, L. Keoki Williams, Inge M. Wouters, James J. Yang, Jing Hua Zhao, Miriam F. Moffatt, Carole Ober, Dan L. Nicolae
Notice bibliographique
RevueNature Genetics · 2017
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversity of AlbertaUniversité du Québec à ChicoutimiOntario Institute for Cancer ResearchMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversity of British ColumbiaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute for Health and Care ResearchNational Cancer InstituteLundbeckfondenWellcome Trust
Mots-clésAsthmaBiologyGenome-wide association studyPleiotropyGeneticsImmunologyGenetic associationEnhancerImmune systemGenotypeGenePhenotypeSingle-nucleotide polymorphismTranscription factor
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations592
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentnon