Crystallization and preliminary structural studies of an aldo-keto reductase from opium poppy
Notice bibliographique
Résumé
Plants are still the source of many widely used pharmaceuticals produced via a plethora of specialized metabolic pathways. Benzylisoquinoline alkaloids (BIA) are a large and diverse group of pharmacologically active compounds found in a variety of plants, including the opium poppy. Among the most important BIAs are morphine and its immediate biosynthetic precursor codeine. In plants, codeine is reduced from codeinone by the enzyme codeinone reductase (COR). However, COR also catalyzes alternative reactions that yield unwanted compounds, such as neopine. These unwanted compounds are a problem in recent attempts at establishing fermentation-based production systems in yeast and bacteria. To understand the molecular structural mechanisms responsible for substrate recognition, and to inform protein engineering efforts to minimalize unwanted alternate reactions, we have crystallized COR and measured diffraction data to 2.7 resolution. The symmetry in the diffraction pattern and systematic absences suggest that the space group is most likely either P6 2 22 or P6 4 22, with unit cell parameters a=b=87.3, c=219.0 . The optimization of crystal quality, cocrystallization of complexes with substrates and substrate analogues/inhibitors, and structure determination using molecular replacement and SAD phasing, are currently in progress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».