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Enregistrement W2780574522 · doi:10.1371/journal.pone.0190149

The burden of hepatitis B virus (HBV) infection, genotypes and drug resistance mutations in human immunodeficiency virus-positive patients in Northwest Ethiopia

2017· article· en· W2780574522 sur OpenAlexafffund
Tekalign Deressa, Debasu Damtie, Kevin Fonseca, Shan Gao, Ebba Abate, Shitaye Alemu, Yetemwork Aleka, Mark G. Swain, Guido van Marle, Carla S. Coffin

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensUniversity of CalgaryProvincial Laboratory of Public Health
Organismes subventionnairesUniversity of GondarUniversity of Calgary
Mots-clésVirologyHepatitis B virusDrug resistanceGenotypeVirusHuman immunodeficiency virus (HIV)Hepatitis BBiologyHepatitis C virusMedicineMicrobiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In sub-Saharan Africa, the hepatitis B virus (HBV) and human immunodeficiency virus (HIV) infections are endemic. Although there has been great progress in HIV care, universal HBV vaccination and care is lacking. In this study, we aimed to determine the prevalence of HBV, HBV genotypes, and drug resistance mutations in dual infected cases in a cohort of HIV patients in Northwest Ethiopia. METHODS: A total of 308 HIV-1 positive patients were enrolled into the study and tested for HBsAg in plasma. In HBsAg positive samples, HBV DNA was analyzed for HBV genotype using in-house nested PCR with HBV-specific pre-core / core or surface primers, and for HBV drug resistance mutations (DRMs) in polymerase region. Odds ratio at 95% confidence interval was calculated. RESULTS: Of the 308 HIV-positive subjects, 62.7% were female, median age 38 years (range 18-68, IQR: 27-49), and the median CD4 count 405 cells/μl (IQR: 75-734). Overall, 94.2% were on antiretroviral therapy (ART) frequently with combinations of Zidovudine (AZT)- Lamivudine (3TC)-Nevirapine (NVP). HBsAg was detected in 5.5% (95%CI 2.95-8.08%) of the study participants, of which the majority were infected with HBV genotype A (7A, 2E, 2D, 1C, 1 G). All HIV/HBV positive cases were on ART with anti-HBV activity (i.e., 3TC) and 3TC associated HBV DRMs (i.e., rtV173L, rtL180M, and rtM204V) were detected in 7/13 (53.8%) subjects. CONCLUSION: In this cross-sectional study of HIV-infected individuals, we found 5.5% HBV/HIV co-infected cases. Most were receiving the first generation anti-HBV therapy with a low genetic barrier to resistance, and several carried mutations associated with anti-HBV (3TC) drug resistance. These data underscore the importance of integrating HBV screening to the HIV treatment guidelines for better management and prevention of HBV-related liver disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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