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Enregistrement W2781481987 · doi:10.1136/gutjnl-2017-315729

Proton-pump inhibitors and increased gastric cancer risk: time-related biases

2018· letter· en· W2781481987 sur OpenAlexaff
Samy Suissa, Alain Suissa

Notice bibliographique

RevueGut · 2018
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHelicobacter pyloriCohortProton-pump inhibitorCancerInternal medicineLatency (audio)Latency stageCohort studyOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We read with interest the cohort study by Cheung et al 1 reporting that use of proton-pump inhibitors (PPIs) after Helicobacter pylori eradication is associated with an increased risk of gastric cancer (GC). We believe that the significantly elevated HR of GC with PPI use (HR 2.44; 95% CI 1.42 to 4.20) is a consequence of two time-related biases. Immortal time bias was introduced by misclassifying exposure,2–4 while latency bias was introduced by not incorporating latency in the exposure definition, a major issue for potential carcinogenic drug effects.5 6 Immortal time in a cohort study refers to a period of follow-up time when the outcome could not occur.3 It arises in this study from the definition of frequency of PPI use, ‘calculated by dividing the total treatment duration by the duration of follow-up’, namely the average use over the entire follow-up. Exposure to PPIs was then categorised ‘into non-regular use (<weekly use; reference group) and regular use (at least weekly use)’.1 Thus, the PPI ‘non-users’ included authentic non-users of PPIs and the non-regular PPI users (less than weekly use), together making up the reference group against which the risk …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,093
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,093
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0180,015
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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