Pediatric oncologist willingness to offer germline <i>TP53</i> testing in osteosarcoma
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Li-Fraumeni syndrome (LFS) is a cancer predisposition syndrome caused by mutations in the tumor-suppressor gene TP53. Osteosarcoma is a sentinel cancer in LFS. Prior studies using Sanger sequencing platforms have demonstrated that 3% of individuals with osteosarcoma harbor a mutation in TP53. New data from next-generation sequencing have demonstrated that 3.8% of patients with osteosarcoma have a known pathogenic variant, and an additional 5.7% carry exonic variants of unknown significance in TP53. METHODS: Pediatric oncologists were e-mailed an anonymous 18-question survey assessing their willingness to offer TP53 germline testing to a child with osteosarcoma with or without a family history, and they were evaluated for changes in their choices with the prior data and the new data. RESULTS: One hundred seventy-seven pediatric oncologists (22%) responded to the survey. Respondents were more likely to offer TP53 testing to a patient with a positive family history (77.4% vs 12.4%; P < .0001). Significantly more providers responded that they would offer TP53 testing once they were provided with the new data (25.4% vs 12.4%; P = .0038). The proportion of providers who responded that they were unsure increased significantly when they were presented with the new data (25.4% vs 10.2%; P = .0002). Potential implications for other family members and the possibility that surveillance imaging would detect new malignancies at an earlier stage were important factors influencing a provider's decision to offer TP53 testing. CONCLUSIONS: Recent data increase the proportion of providers willing to offer testing, and this suggests concern on the part of pediatric oncologists that variants of unknown significance may be disease-defining in rare cancers. Cancer 2018;124:1242-50. © 2018 American Cancer Society.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,021 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».