Molecular Characterization of Penicillinase–Producing <i>Neisseria gonorrhoeae</i> Isolated in Two Time Periods, 2003–2004 and 2014–2015, in Italy
Notice bibliographique
Résumé
The emergence of antibiotic resistant strains poses a great concern for gonorrhea treatment. The aim of this study was to characterize penicillinase–producing Neisseria gonorrhoeae (PPNG) isolates collected in Italy in two time frames, 2003–2004 and 2014–2015. A total of 80 PPNG were characterized for the bla TEM gene variant and the plasmid type. Furthermore, gonococci were typed using Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence typing. Antibiotic susceptibility assay was performed for penicillin, ciprofloxacin, ceftriaxone, and spectinomycin by Etest and minimum inhibitory concentration (MIC) test strip methods. The β-lactamase production was detected using nitrocefin test. Among PPNG isolates, four bla TEM alleles were identified as follows: bla TEM-1 , bla TEM-228 , bla TEM P14S, and bla TEM-135 . The African plasmid possessed the bla TEM-1 , bla TEM-228 , and bla TEM P14S, whereas bla TEM-135 was identified in Toronto/Rio and Asian plasmids. The percentage of isolates with the bla TEM-1 -carrying African plasmid increased from 42.5% in 2003–2004 to 55% in 2014–2015; conversely, the isolates with bla TEM-135 -carrying Toronto/Rio plasmid decreased from 57.5% to 35%. Among the isolates carrying the Toronto/Rio plasmids possessing bla TEM-135 , sequence type (ST)661 and ST5624 were found to be the predominant STs in both periods 2003–2004 and 2014–2015, respectively. More than half of the PPNG isolates were resistant to ciprofloxacin. Increase in the isolates carrying the African plasmid possessing bla TEM-1 and a parallel decrease of the bla TEM-135 -carrying Toronto/Rio plasmid was observed. Moreover, PPNG isolate harbored Toronto/Rio plasmid with bla TEM-135 belonged mainly to two major STs (ST661 and ST5624). Given the possible role of a mutated bla TEM gene as an additional mechanism to extended spectrum β-lactamase resistance, it is crucial to monitor gonococci carrying these resistance genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».