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Enregistrement W2782014230 · doi:10.1126/science.aao0827

Rapid genome shrinkage in a self-fertile nematode reveals sperm competition proteins

2018· article· en· W2782014230 sur OpenAlexafffund
Da Yin, Erich M. Schwarz, Cristel G. Thomas, Rebecca L. Felde, Ian Korf, Asher D. Cutter, Caitlin Schartner, Edward J. Ralston, Barbara J Meyer, Eric S. Haag

Notice bibliographique

RevueScience · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGordon and Betty Moore FoundationU.S. Department of AgricultureNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésBiologySelfingOutcrossingGenomeNematodeGeneticsGeneSpermGenome sizeEvolutionary biologySperm competitionEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Examining the consequences of selfing The Caenorhabditis genus of nematodes includes a mix of closely related outcrossing and self-fertilizing (selfing) species. Genome size differs widely among these different species. Yin et al. generated a genome assembly for the outcrossing nematode C. nigoni and compared it with that of its close relative, the selfing C. briggsae. C. briggsae has experienced a substantial decrease in genome size since the two species' recent divergence. The underlying causes of this size difference appear to involve a decrease in protein-coding genes and changes in other types of sequences that have homology with RNAs expressed primarily in C. nigoni males. One of the implicated gene families, the mss family, compromises sperm competitiveness. Thus, in nematodes, selfing appears to result in a decrease in genome size owing to selection to reduce male reproductive function. Science , this issue p. 55

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations134
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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