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Enregistrement W2782288192 · doi:10.1002/bip.23094

An entirely fmoc solid phase approach to the synthesis of daptomycin analogs

2018· article· en· W2782288192 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePeptide Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDaptomycinChemistryAlanineLiposomeStereochemistryLipopeptideMembraneIn vitroCombinatorial chemistryBiophysicsStaphylococcus aureusBiochemistryAmino acidBacteriaBiologyVancomycin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Daptomycin is an important Ca 2+ ‐dependent cyclic lipodepsipeptide antibiotic used to treat serious gram‐positive infections. The search for daptomycin analogs with improved activity and their application as tools for studying its mechanism of action has prompted us to develop an entirely Fmoc solid phase approach to the synthesis of daptomycin analogs. Key to the success of this approach was the development of conditions that allowed for the formation of the ester bond on resin‐bound peptides consisting of residues 1‐10 and the decanoyl lipid tail. The esterification reaction proceeded more efficiently on Tentagel resin as opposed to standard polystyrene resin. This approach was used to synthesize a series of analogs in which each position of Dap‐E12‐W13, a relatively active daptomycin analog, was individually substituted by alanine. Only positions 2, 6, and 11 were found to be amenable to substitution by alanine in that the corresponding alanine analogs were only 1.5‐ to 4‐fold less active than Dap‐E12‐W13. We also found that the daptomycin analog, Dap‐K6‐E12‐W13, exhibits in vitro activity approaching that of daptomycin at physiological Ca 2+ concentration. Studies with Dap‐K6‐E12‐W13 and model liposomes indicate that this analog interacts with membranes by the same mechanism as daptomycin. This analog is currently being used as a lead for the development daptomycin analogs with improved activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle